Vyšetření HLA systému a KIR genů u dárců a příjemců kostní dřeně
Study of HLA antigens and KIR genes in a donors and recipients of bone marrow
bachelor thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/87540Identifiers
Study Information System: 185703
Collections
- Kvalifikační práce [20084]
Author
Advisor
Consultant
Holáň, Vladimír
Referee
Froňková, Eva
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular Biology and Biochemistry of Organisms
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
5. 6. 2017
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
HLA, KIR, transplantace hematopoetických kmenových buněk, HLA typizace, KIR typizaceKeywords (English)
HLA, KIR, hematopoietic stem cell transplantation, HLA typing, KIR typingHLA a KIR geny dosahují vysoké míry polymorfismu v rámci lidského genomu. Proteinové produkty těchto genů hrají významnou roli při transplantacích hematopoetických kmenových buněk. Genetická shoda na úrovni HLA genů mezi recipientem a donorem představuje hlavní rizikový faktor přihojení transplantátu a následné úspěšné léčby. Z tohoto důvodu je nezbytná genotypizace donorů a recipientů indikovaných k transplantaci hematopoetických kmenových buněk. Za účelem vyšetření se využívají různé modifikace polymerázové řetězové reakce a přímé sekvenování, typizovány jsou geny HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1 a HLA-DQB1 na úrovni high- a low- rozlišení. Na základě typizace těchto genů je aplikována tzv. 10/10 shoda při výběru vhodného donora v registru dárců. Při léčbě pacientů s diagnostikovanou akutní myeloidní leukémií zvyšuje pravděpodobnost potlačení relapsu onemocnění a obecné přežití pacientů KIR genotyp donorů, nejvyššího léčebného efektu dosahuje Cen-B/B dárcovský haplotyp. Z tohoto důvodu dochází k typizaci KIR pomocí polymerázové řetězové reakce, výsledný genotyp je porovnáván online kalkulátorem v IMGT/KIR databázi. Vybraní donoři jsou selektováni do skupin dle svého genotypu a jeho vlivu na výsledný efekt léčby. Studium polymorfních systémů a vývoj metod genetické typizace donorů a recipientů...
HLA and KIR genes are highly polymorphic regions within the human genome. Protein products of these genes play a critical role in hematopoietic stem cell transplantation. Genetic HLA match is a major barrier to engraftment and influences the outcome of this therapy. Therefore it is necessary to genotype donors and recipients selected for hematopoietic stem cell transplantation. Today HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1 and HLA-DQB1 genes are tested by modifications of polymerase chain reaction or by sequence-based typing methods on the level of high- or low-resolution. Donors registered in bone marrow registries are selected on the basis of a 10/10 match. Donors KIR genotype leads to a better outcome, to relapse-free survival and overall survival in treatment of patients with acute myeloid leukemia. A better protection against relapse is achieved by Cen-B/B donor haplotype. Therefore KIR typing by polymerase chain reaction is used and the genotype is compared with the IMGT/KIR database by an online B- content calculator. Donors are divided in groups according to their genotype and their influence on the success of treatment for acute myeloid leukemia. The study of polymorphic systems and the development of genotyping donors and recipients significantly improve the outcome of hematopoietic stem cell...