The influence of non-domain regions' composition on the activity of multi-domain protein kinases

Abstract

Kinases are among the most studied proteins, as they are important in many cellular processes. Today's research shows that their activity is not only dependent on the composition of the domains, but on the non-domain regions as well. This thesis tried to comprehend the influence of the link- ers' composition on the function of multi-domain protein kinases in general. This was done by clustering human two-domain protein kinases with one protein kinase domain by the averaged physicochemical attributes of their inter-domain regions. The uniqueness of Gene Ontology terms and Enzyme Commission numbers within these clusters of proteins with different archi- tectures was then investigated. However, due to multiple missteps, no such influence has been witnessed. 1

Kinásy jsou jedny z nejvíce studovaných proteinů, neboť hrají důleži- tou roli v mnohých buněčných procesech. Aktuální výzkum prokazuje, že jejich aktivita není závislá pouze na komposici domén, nýbrž taktéž na ne- doménových regionech. Tato bakalářská práce si dala za cíl obecně porozumět vlivu složení linkerů na funkci vícedoménových protein kinás. Dvoudoménové lidské protein kinásy s jedinou kinásovou doménou byly zklastrovány dle zprůměrovaných fysikálně chemických vlastností mezidoménových oblastí, načež se zkoumala unikátnost Gene Ontology a Enzyme Commission pojmů v rámci nalezených klastrů složených z proteinů různých architektur. Ovšem vzhledem k víceru nedostatkům, žádný takový vliv nebyl pozorován. 1