Antigenome defines a selection of mutated tumor peptides driving tumor-specific T-cell response
Antigenom definuje výběr mutovaných peptidů pro nádorově-specifickou T-buněčnou imunitní odpověď
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/75182Identifikátory
SIS: 167819
Kolekce
- Kvalifikační práce [19113]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Dibus, Michal
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Molekulární biologie a biochemie organismů
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
8. 9. 2016
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
antigenom, T-buněčná odpověď, somatická mutace, MHC-restrikce, nádorový biomarker, imunoterapie nádorů, stratifikace pacientů, personalizovaná medicínaKlíčová slova (anglicky)
antigenome, T-cell response, somatic mutation, MHC-restriction, tumor biomarker, tumor immunotherapy, patient stratification, personalized medicineT buňky, nezastupitelná součást adaptivního imunitního systému, hrají důležitou roli při eradikaci růstu nádoru. T buňky antigenně-specificky cílí, zajišťují interakci a následně i likvidují nádorové buňky. Interakci T buněk s nádorovými buňkami zprostředkovávají krátké, nádorově specifické epitopy. Epitopy jsou T buňkám prezentovány na povrchu nádorových buněk navázané na molekuly hlavního histokompatibilního komplexu (MHC). Nádorově specifické epitopy vznikají v důsledku náhodných somatických mutací a jsou součástí nádorového antigenomu. Antigenom se skládá ze dvou skupin antigenů, nádorově specificických (TSA) a asociovaných s nádory (TAA). TSA jsou unikátní pro každý nádor zatímco TAA jsou prezentovány nádorovými i vlastními buňkami pacienta. Nádorové buňky vyvinuly několik způsobů jak imunitní reakci na úrovni T buněk, NK buněk, makrofágů i dalších mechanismů uniknout. Navzdory tomu, má imunoterapie v personalizované medicíně obrovský potenciál. Stratifikace reagujících pacientů je pro nasazení vhodné léčbu zcela zásadní. Využití spektra metod umožnilo studium mutací u jednotlivých pacientů, role mutací ve vývoji nádoru, existujících reaktivních T buněčných klonů a přítomných specifických epitopů. Tyto poznatky pomáhají navrhnout nejefektivnější stratifikace a eventuálně i léčbu zacílenou na...
T cells, as an essential part of the adaptive immune system, play crucial role in eradication of tumor growth. T cells target, interact with and eventually annihilate the tumor cells in antigen- specific (Ag) manner. T cells interact with tumor cells via short epitopes bound to the major histocompatibility complex (MHC) molecules on the tumor cell surface. Tumor specific neoepitopes arise from random somatic mutations and constitute a part of the tumor antigenome. Antigenome comprises of two classes of antigens, tumor specific antigens (TSA) and tumor associated antigens (TAA). TSA are neoantigens carrying neoepitopes unique to each tumor. TAA are self-antigens presented by both tumor cells and non-transformed cells. Each tumor cell is able to develop numerous ways to evade the immune system consisting of T cells, NK cells, macrophages and other mechanisms employed. Despite that immunotherapy has shown a great potential in personalized medicine. The stratification of responsive patients is essential for effective and durable management of therapy in clinical practice. Methods are employed, which study existing reactive T cell clones, somatic mutations present in each patient, role of somatic mutations in tumor development and present neoepitopes. All these patient- specific features facilitate...