Analýza genové exprese metodami sekvenace nové generace

Abstract

1 Abstrakt Cílem práce je vytvořit přehled dnes dostupných metod analýzy genové exprese, uvést výhody a nevýhody daných metod a porovnat je. Sekvenování je dnes jedna z nejpoužívanějších molekulárních metod. Sekvenovací metody se dají rozdělit na tři skupiny, sekvenování první generace, druhé generace a třetí generace. Nejvíce využívanými jsou metody sekvenování druhé generace. Avšak velký potenciál má i třetí generace, u které se ztrácí důležitost amplifikace vzorku pomocí PCR. Díky klesajícím nákladům a stoupající efektivitě se ale rapidně zvyšuje i množství dat. Rostou tak nároky na datová úložiště, výkon počítačů a důmyslnost softwarů, které velmi usnadňují zpracování získaných informací.

1 Abstract The main task of this work is create review today's available methods for gene expression analysis, introduce advantages and disadvantages of this metods and compare them. Nowadays sequencing is one of the most usable molecular methods. Sequencing methods are divided to three groups, a first generation sequencing, a second generation sequencing and a third generation sequencing. The most useful are the second generation sequencing. However, the third generation sequencing have a big potencial too. It is not necessary amplificate samples using PCR thanks them. Amount of data raises rapidly, thanks decreasing costs and increasing efficiency. Demands on data starage, computers output are growing. And softwares for data analysis are much clever than ever before.