Image Analysis in Microscopy and Videokymography

Abstract

13551396715155-b09dc292308c6b63db6c80c0e7f4c08e.txt Tato disertační práce popisuje nové metody pro automatické zpracování obrazových dat v biologii, fyzice a medicíně. Navržené metody slouží k rekonstrukci mikroskopických snímků rostoucích mikroorganismů v intervalech mezi pozorováními, k měření částic na snímcích mikroskopu atomárních sil a k vyhodnocení parametrů kmitání hlasivek na videokymografických snímcích. Příslušná obrazová data byla zatím zpracovávána převážně vizuálně. Navržené metody umožňují automatické či počítačem podporované zpracování těchto dat, čímž usnadňují jejich vyhodnocování. Vyvinuté metody byly testovány na reálných snímcích. Výsledky automatického zpracování byly srovnatelné s reálnými hodnotami nebo s výsledky vizuálního vyhodnocení. Aplikace navržených metod není omezena na konkrétní typ obrazových dat. Metody mohou být použity obecně ke zpracování snímků s podobnými vlastnostmi. Page 1

13551398399831-171f83a418df200fec6f622f22b6fb3d.txt The Thesis describes new methods for automatic processing of image data in biology, physics and medicine. The developed methods reconstruct light microscopy images of growing microorganisms in intervals between observations, measure particles in atomic force microscopy images, and evaluate parameters of vocal fold vibrations in videokymographic images. All three problems have been hitherto solved primarily visually. The proposed methods allow automatic or computer-aided processing of the image data, and thus facilitate the evaluation process. Performance of the developed methods was tested on real images; the results were comparable with ground truth or results of visual evaluation. Application of the developed methods is not limited to the specific type of image data; the methods can be used in general for processing of images with similar characteristics. Page 1