Image Analysis in Microscopy and Videokymography
Analýza obrazu v mikroskopii a videokymografii
dizertační práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/59381Identifikátory
SIS: 42519
Kolekce
- Kvalifikační práce [10690]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Jan, Jiří
Cristobal, Gabriel
Fakulta / součást
Matematicko-fyzikální fakulta
Obor
Softwarové systémy
Katedra / ústav / klinika (externí)
Informace není k dispozici
Datum obhajoby
19. 3. 2013
Nakladatel
Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Prospěl/a
Klíčová slova (česky)
analýza obrazu, počítačem podporované vyhodnocování, světelná mikroskopie, mikroskopie atomárních sil, videokymografieKlíčová slova (anglicky)
image analysis, computer-aided evaluation, light microscopy, atomic force microscopy, videokymography13551396715155-b09dc292308c6b63db6c80c0e7f4c08e.txt Tato disertační práce popisuje nové metody pro automatické zpracování obrazových dat v biologii, fyzice a medicíně. Navržené metody slouží k rekonstrukci mikroskopických snímků rostoucích mikroorganismů v intervalech mezi pozorováními, k měření částic na snímcích mikroskopu atomárních sil a k vyhodnocení parametrů kmitání hlasivek na videokymografických snímcích. Příslušná obrazová data byla zatím zpracovávána převážně vizuálně. Navržené metody umožňují automatické či počítačem podporované zpracování těchto dat, čímž usnadňují jejich vyhodnocování. Vyvinuté metody byly testovány na reálných snímcích. Výsledky automatického zpracování byly srovnatelné s reálnými hodnotami nebo s výsledky vizuálního vyhodnocení. Aplikace navržených metod není omezena na konkrétní typ obrazových dat. Metody mohou být použity obecně ke zpracování snímků s podobnými vlastnostmi. Page 1
13551398399831-171f83a418df200fec6f622f22b6fb3d.txt The Thesis describes new methods for automatic processing of image data in biology, physics and medicine. The developed methods reconstruct light microscopy images of growing microorganisms in intervals between observations, measure particles in atomic force microscopy images, and evaluate parameters of vocal fold vibrations in videokymographic images. All three problems have been hitherto solved primarily visually. The proposed methods allow automatic or computer-aided processing of the image data, and thus facilitate the evaluation process. Performance of the developed methods was tested on real images; the results were comparable with ground truth or results of visual evaluation. Application of the developed methods is not limited to the specific type of image data; the methods can be used in general for processing of images with similar characteristics. Page 1