Studium proteomu dentinu lidských zubů
Proteomic study of human tooth dentin
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/56207Identifikátory
SIS: 115894
Kolekce
- Kvalifikační práce [20052]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Pacáková, Věra
Oponent práce
Vrbacký, Marek
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Klinická a toxikologická analýza
Katedra / ústav / klinika
Katedra analytické chemie
Datum obhajoby
10. 6. 2013
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
Dentin, proteomická studieKlíčová slova (anglicky)
Dentin, proteomic studyAnalýza proteomu dentinu v lidských zubech dospělých jedinců byla provedena za účelem optimalizace analýzy proteinů zubního dentinu metodou dvourozměrné gelové elektroforézy (2-DE). Zuby moudrosti byly očištěny, rozdrceny a extrahovány v guanidinovém a EDTA pufru. Extrahované proteiny byly separovány 2-DE, naštípány trypsinem na peptidy a následně bylo ve vzorcích pomocí nLC MS/MS identifikováno celkem 7 proteinů. Využití IPG stripů s různou škálou oblasti pH gradientu a následné srovnání 2 DE gelů bohužel nepřineslo významné nové informace, neboť byly identifikovány především keratiny, kolageny a sérový albumin.
Proteome analysis of dentin in human teeth adult subjects was conducted to optimize the two dimensional gel electrophoresis (2-DE) analysis of proteins from the dental tissue. The third molar teeth were cleaned, crushed and extracted in guanidine and EDTA buffer. Extracted proteins were separated by 2-DE, digested with trypsin to peptides and subsequently analyzed using nLC MS/MS. Totally, 7 unique proteins were identified in the samples. The use of IPG strips with different range of the pH gradient and the subsequent comparison of 2 DE gels unfortunately did not bring important new information, because common keratin, collagen and serum albumin proteins were identified.