Výskyt a biologická souvislost chromozomálně integrovaného šestého lidského herpesviru (HHV6) v české populaci
Prevalence and biological consequence of chromosomally integrated human herpesvirus 6 (HHV-6) in Czech population
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/54345Identifiers
Study Information System: 66933
CU Catalogue: 990016264630106986
Collections
- Kvalifikační práce [22318]
Author
Advisor
Referee
Lengerová, Martina
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Anthropology and Human Genetics
Department
Department of Anthropology and Human Genetics
Date of defense
10. 9. 2013
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Very good
Keywords (Czech)
HHV-6A HHV-6B herpesvirus epidemiologická studie chromozomální integraceKeywords (English)
HHV-6A HHV-6B herpesvirus epidemiological study chromosomal integration7 Abstrakt Šestý lidský herpesvirus (HHV-6) je komplexem dvou blízce příbuzných DNA virů: HHV- 6A a HHV-6B. Primoinfekce probíhá už v raném dětském věku ať již ve formě šesté exantémové nemoci, nebo asymptomaticky. Oba viry HHV-6 jsou schopny se rekombinačními mechanismy integrovat do lidského genomu. Tato vlastnost je vzhledem k ostatním lidským herpetickým virům jedinečná. Tato diplomová práce se věnuje studiu Ci-HHV-6 ve zdravé populaci a ve skupině s maligním onemocněním. Testovali jsme 812 pacientů s maligním onemocněním a 420 osob ze zdravé populace. Přítomnost HHV-6 DNA jsme určili pomocí real-time PCR, lokalizaci integrace viru jsme pak detekovali pomocí fluorescenční hybridizace in situ (FISH). Srovnávací studií jsme nezjistili statisticky významný rozdíl ve frekvenci Ci-HHV-6 u pacientů s maligním onemocněním (1,11%) a zdravé kontrolní skupiny (0,95%) (P=0,8). U potvrzených integrací jsme dále prokázali dědičnost tohoto fenoménu u rodinných příslušníků. Pomocí FISH jsme lokalizovali Ci-HHV-6 do telomerických oblastí chromozomů 2 a 18. Otestovali jsme také tvorbu virových proteinů u nosičů Ci-HHV-6 pomocí detekce mRNA. V rámci této práce jsme provedli první epidemiologickou studii výskytu Ci-HHV-6 v populaci zdravých dárců v České republice a zavedli jsme nové metody k lepší charakteristice tohoto...
8 Abstract Human Herpes Virus 6 (HHV-6) consists of two closely related DNA viruses: HHV-6A and HHV-6B. The primoinfection proceeds at an early childhood usually as sixth exanthem disease or without any clinical symptoms. Both HHV-6 viruses are able to integrate to human genome using recombinant mechanisms which is unique compared to other human herpesviruses. The aim of the thesis is to study Ci-HHV-6 in a group of patients with malign disease and in the healthy population. We analysed 812 patients with malign disease and 420 healthy subjects from general population. The Ci-HHV-6 was assessed by real-time PCR, the specific localization of Ci-HHV-6 was determined using fluorescent in situ hybridization (FISH). Using comparative study, we did not identify significant difference between frequency of Ci-HHV-6 in patients with malign disease (1.11%) and healthy subjects (0.95%) (P-value 0.8). Consequently, we proved the heritability of Ci-HHV-6 in affected families. We determined the localization of Ci-HHV-6 to telomeric regions of chromosomes 2 and 18. We studied the production of viral proteins in the subjects with Ci-HHV-6. In this work, we conducted the first epidemiological study of Ci-HHV-6 in the Czech Republic. We also introduced novel methods which contribute to better characterization of this phenomenom.
