Na velikosti záleží - biogeneze a funkce siRNA u Arabidopsis
Size matters - siRNAs biogenesis and function in Arabidopsis
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/53565Identifikátory
SIS: 130449
Kolekce
- Kvalifikační práce [19592]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Tyč, Dimitrij
Oponent práce
Honys, David
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Molekulární biologie a biochemie organismů
Katedra / ústav / klinika
Katedra experimentální biologie rostlin
Datum obhajoby
6. 6. 2013
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
Arabidopsis thaliana, miRNA, nat siRNA, PTGS, RNAi, sRNA (malé RNA), siRNA, ta siRNA, TGSKlíčová slova (anglicky)
Arabidopsis thaliana, miRNA, nat siRNA, PTGS, RNAi, sRNA (small RNA), siRNA, ta siRNA, TGSRNA interference (RNAi) hraje důležitou roli v různých biologických procesech zahrnujících regulaci genů a transposonů, vývoje částí rostlinného těla, reakci na stres, remodelaci chromatinu a antivirovou obranu. Základem RNAi jsou krátké molekuly RNA (malé RNA, sRNA), které rostliny produkují ve velikostním rozmezí 21 - 24 nukleotidů (nt) a které jsou schopny na základě komplementarity rozpoznat cílové molekuly RNAi. Malé RNA lze rozdělit na dva základní typy: microRNA (miRNA) a malé interferující RNA (siRNA). K tvorbě a aktivitě malých RNA jsou potřeba proteiny z několika genových rodin: DICER-LIKE (DCL) vytváří malé RNA z dvouvláknového RNA prekurzoru, který je často tvořen aktivitou RNA dependentní RNA polymerázy (RDR). Proteiny ARGONAUTE (AGO) s těmito malými RNA asociují a vytváří tak RNA-indukovaný umlčující komplex (RISC), který hraje klíčovou roli v rozpoznání cílové molekuly a ve výkonné fázi RNAi. Na to, jakou dráhou se bude RISC komplex ubírat, má vliv velikost, struktura i biogeneze malé RNA. RNAi působí jednak na post-transkripční úrovni (PTGS), formou degradace cílové RNA či blokováním translace, a jednak na transkripční úrovni (TGS), kde sRNA zprostředkovávají metylaci histonů a DNA.
RNA interference (RNAi) play a key role in various biological processes including regulation of gens and transposons, phylogenetic of part plant body, stress response, chromatin remodeling and antiviral mechanism. The ground of RNAi is short RNA molecules (small RNA, sRNA). In plants they are produced in range from 21 to 24 nucleotides (nt) and on the basis of being complementary they recognize target molecule of RNAi. It is possible to divide small RNA in two basic classes: microRNAs (miRNA) and small interfering RNAs (siRNA). To product and put small RNA into activate needs proteins from several gene family. DICER-LIKE (DCL) proteins create small RNAs from double-strand RNA precursors, which are often created by RNA dependent RNA polymerase (RDR) activity. With these small RNAs interact ARGONAUTE (AGO) proteins and together create RNA-Induced Silencing Complex (RISC). Those complexes play a key role in recognizing target molecule in active phase of RNAi. Structure and biogenesis of sRNAs has decisive influence on RISC complex and its next way in biogenesis. RNAi cause effect on post-transcriptional level (PTGS), as degradation of target molecule or repression of translation. And on transcriptional level (TGS) as sRNA intermediate histone and DNA methylation.
Citace dokumentu
Metadata
Zobrazit celý záznamSouvisející záznamy
Zobrazují se záznamy příbuzné na základě názvu, autora a předmětu.
-
Ovlivnění kvality, funkce a výsledků transplantace pankreatických ostrůvků pomocí RNA interference
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOKosinová, Lucie (Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta, 2022)Datum obhajoby: 22. 6. 2022Transplantation of insulin producing tissue is the only therapeutic method so far allowing type 1 diabetic patients to achieve long-term independence of insulin administration. Transplantation of isolated pancreatic islets ... -
Metody RNAi a CRISPR a jejich využití pro genetické manipulace parazitických protist
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOKaiserová, Veronika (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2017)Datum obhajoby: 12. 9. 2017RNA interference slouží jako obranný mechanismus, pomocí něhož se organismy brání proti cizorodým nukleovým kyselinám. RNAi negativně ovlivňuje translaci vazbou malých nekódujících molekul RNA ke komplementárnímu úseku ... -
Dopravní systémy na bázi syntetických hydrofilních polymerů pro přenos a řízené uvolňování siRNA
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOBlažková, Jana (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2015)Datum obhajoby: 15. 9. 2015Terapeutika na bázi siRNA představují slibnou naději pro léčbu řady vrozených i získaných onemocnění. Princip metody spočívá v posttranskripčním umlčení patologického genu nebo souboru genů (tzv. RNAi proces), které jsou ...