In silico predikce posttranslačních modifikací

Abstract

Posttranslační modifikace mají důležitou úlohu v regulaci buněčných pochodů včetně metabolismu, růstu, diferenciace, transkripční aktivace, membránového přenosu a buněčného stárnutí. Experimentální detekce PTM (zejména fosforylace) za použití protilátek je stále časově i finančně náročná. Rozvoj in silico metod pro predikci fosforylace byl v posledních letech ovlivněn velkým nárůstem sekvenčních dat, které jsou vhodným zdrojem pro "trénink", zpracování a výslednou interpretaci predikčních výsledků. In silico predikce PTM může tedy usnadnit identifikaci potencionálních fosforylačních míst a urychlit tím základní výzkum.

Post-translational modifications are an important form of cellural regulation, including matabolism, growth, differentiation, transcription activation, membrane transport and cell death. Experimental identification of post-translational modifications (PTMs), especially phosporylation, is still time consuming and expensive. Progress in silico PTM prediction tools was influnced an enormous growth of known sequences which are suitable for training set, processing and final result's interpretation. In silico prediction may facilitate the identification of potencional phosporylation sites and it may speed up in future research.