Príprava monoklonálnej protilátky proti hlavnému štruktúrnemu proteínu VP1 BK vírusu a konštrukcia plazmidov pre vyhľadávanie proteínových interakcií metódou BiFC.
Preparation of monoclonal antibody against the major structural protein, VP1, of BK virus and construction of plasmids for protein interaction analysis by BiFC method.
Příprava monoklonální protilátky proti hlavnímu strukturnímu proteinu VP1 BK viru a konstrukce plasmidů pro vyhledávání proteinových interakcí metodou BiFC.
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/48471Identifiers
Study Information System: 67154
Collections
- Kvalifikační práce [19610]
Author
Advisor
Referee
Němečková, Šárka
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Genetics, Molecular Biology and Virology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
12. 9. 2011
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Slovak
Grade
Very good
Hlavným cieľom práce bolo vytvorenie monoklonálnej protilátky proti VP1 proteínu BK vírusu pre štúdium jednotlivých krokov jeho replikačného cyklu. BK vírus je ľudský polyomavírus spôsobujúci u imunosuprimovaných pacientov závažné ochorenie - nefropatiu asociovanú s polyomavírusom (PVAN) po transplantácii obličiek, alebo hemoragickú cystitídu po transplantácii kostnej drene. Virióny BK vírusu majú kapsidu s ikozahedrálnou symetriou pozostávajúcu z 360 molekúl hlavného kapsidového proteínu VP1 a dvoch minoritných štruktúrnych proteínov VP2 a VP3, které však nie sú exponované na povrchu kapsidy. VP1 je silne imunogénny, čo dáva možnosť produkovať protilátky umožňujúce sledovanie BK vírusu detekciou kapsidového proteínu. Ako antigén pre imunizáciu myší pre prípravu hybridómov boli použité štruktúry prázdnych BK vírusových kapsíd produkovaných v hmyzích bunkách z rekombinantného bakulovírusu. Klonovaním hybridómov vzniknutých fúziou myelómových buniek a B-lymfocytov z imunizovanej myši sa podarilo získať radu primárnych klonov. Jeden z nich bol klonovaný do homogenity a monoklonálna protilátka proti VP1 BK vírusu bola čistená z hybridómového média afinitnou chromatografiou. Z výsledkov testovania vyplýva, že získaná protilátka 5/G10/A5/B2/8 rozpoznáva konformačný epitop a dá sa používať pre detekciu...
The aim of this study was to create a monoclonal antibody against VP1 protein BK virus for study of individual steps of its replication cycle. BK virus is human polyomavirus which causes serious disease - polyomavirus associated nephropathy in immunocompromised patients after renal transplantation or hemorrhagic cystitis after bone-marrow transplantation. Virions of BK virus have capsids with icosahedral symmetry consisting of 360 molecules of the major capsid protein VP1 and two minor structure proteins VP2 and VP3, which are not exposed on the capsid surface. VP1 is highly immunogenic what gives us possibility to produce antibodies capable of BK virus monitoring by capsid protein detection. Empty BK virus particles produced in insect cells from a recombinant baculovirus were used as antigen to immunize mice for preparing hybridomas. Cloning of hybridomas created by fusion of myeloma cells with B-lymphocytes from immunized mouse gave us series of primary hybridoma clones. One of them, 5/G10/A5/B2/8, was cloned to homogenity and monoclonal antibody against VP1 BK virus was purified from hybridomas medium by affinity chromatography. The analysis of antibody properties revealed that it recognizes a conformation epitope and can be used for VP1 protein and virion detection in cells by indirect...