CRISPR/Cas genome editing in human disease models and the translation into therapies
Editace genomu pomocí CRISPR/Cas na modelech lidských onemocnění a jejich využití v terapii
bachelor thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/190002Identifiers
Study Information System: 263248
Collections
- Kvalifikační práce [19610]
Author
Advisor
Referee
Šedová, Lucie
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular Biology and Biochemistry of Organisms
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
30. 5. 2024
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
vzácná onemocnění, myší model, CRISPR, Cas9, knock-out, kondicionální knock-out, knock-in, transgenní myši, editace bází, primární editaceKeywords (English)
rare diseases, mouse model, CRISPR, Cas9, knock-out, conditional knock-out, knock-in, transgenic mice, base editing, prime editingVzácná onemocnění, jak už jejich název napovídá, individuálně postihují jen malý počet lidí na celém světě. Vzhledem k jejich nízké prevalenci je nalezení vhodné terapie velmi obtížné. Neuspokojivé pochopení molekulárních příčin a mechanismů, které je provázejí, a nemožnost provádět klinické studie v obvyklém rozsahu v důsledku nízkého výskytu vzácných onemocnění patří k hlavním problémům, které zbržďují vývoj vhodné léčby. Tvorba myších modelů je slibnou cestou k vyřešení těchto obtíží, neboť myši mají řadu vlastností nezbytných pro modelování lidských onemocnění. CRISPR/Cas9 umožňuje vědcům provádět přesné změny v genomu pomocí nukleázy Cas9, která vytváří dvouřetězcové zlomy v DNA poté, co ji speciálně navržená guide RNA přivede k místu zájmu. Pokud je sekvence zvoleného místa známá, lze možné úpravy zavést téměř kamkoliv do genomu a jejich repertoár je navíc prakticky nekonečný. Využití CRISPR/Cas9 technologie se ukázalo být ideální pro tvorbu myších modelů vzácných onemocnění, neboť většina těchto poruch je způsobena genetickými mutacemi, které dokáže tato metoda plně napodobit. Tato práce se zaměřuje na strategie využívané při tvorbě myších modelů pomocí systému CRISPR/Cas9 a shrnuje jejich podrobné mechanismy. Klíčová slova: vzácná onemocnění, myší model, CRISPR/Cas9, knock-out,...
Rare diseases, as their name indicates, individually affect only a low number of people around the world. Due to their low prevalence, finding appropriate therapy is very difficult. Insufficient understanding of the molecular causalities and mechanisms accompanying these disorders and the inability to conduct clinical studies to the usual extent due to the low occurrence of rare diseases belong to the main problems hindering the development of proper treatment. The creation of mouse models is a promising way to solve these difficulties since mice have numerous qualities necessary for modelling human diseases. CRISPR/Cas9 enables scientists to make precise changes in the genome by employing Cas9 nuclease which creates double-strand breaks in the DNA after the specifically designed guide RNA leads it to the site of interest. If the sequence of the chosen site is known, the possible edits can be installed almost anywhere in the genome and, moreover, their repertoire is practically endless. The use of the CRISPR/Cas9 technology proved to be perfect for creating mouse models of rare diseases as most of these disorders are caused by genetic mutations that this method is fully capable of mimicking. This thesis focuses on strategies used in creating such mouse models with the CRISPR/Cas9 system and...
Citace dokumentu
Metadata
Show full item recordRelated items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Genes participating in response to Leishmania major revealed by targeted mutation.
Defence status: DEFENDEDEzrová, Zuzana (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2014)Date of defense: 13. 6. 2014Leishmania major je intracelulární parazit, kterému se v mnoha případech daří úspěšně množit a šířit se v těle hostitele. Děje se tak díky strategiím, pomocí nichž Leishmanie unikají složkám imunitního systému daného ... -
Nové molekulární nástroje pro manipulaci s genovou expresí Giardia intestinalis.
Defence status: DEFENDEDHoráčková, Vendula (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2022)Date of defense: 26. 5. 2022Giardia intestinalis is a widespread intestinal parasite that causes diarrhea in human and other vertebrate hosts. Although, fully sequenced genome of G. intestinalis has been published, very little is known about the ... -
Creating a biosensor for miRNA effector complex formation using CRISPR nucleases
Defence status: DEFENDEDPetržílek, Jan (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2018)Date of defense: 17. 9. 2018miRNAs are small regulatory RNAs, which function as post-transcriptional mRNA regulators. They direct ribonucleoprotein complexes to cognate mRNA to repress them by translational inhibition and degradation. miRNAs regulate ...