Polyglutamylation as a Posttranslational Tubulin Modification
Polyglutamylace jako posttranslační modifikace tubulinu
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/177325Identifiers
Study Information System: 229996
Collections
- Kvalifikační práce [19611]
Author
Advisor
Referee
Dráber, Pavel
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Cell Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
19. 9. 2022
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
α-tubulin, TTLL11, polyglutamylace, tyrozinace tubulinu, detyrozinace tubulinu, Δ3 tubulinKeywords (English)
α-tubulin, TTLL11, polyglutamylation, tubulin tyrosination, tubulin detyrosination, Δ3 tubulinα-tubulin je nezbytným proteinem pro přežití každé eukaryotické buňky. Společně s β-tubulinem polymerizuje do mikrotubulů, které se následně podílejí na formování a udržování tvaru buňky a ustavení jejích částí. Mikrotubuly vytvářejí komplexní síť, která prochází celým tělem buňky a poskytuje mnoho vazebných míst pro širokou paletu proteinů. Neuspořádané C-konce α- a β-tubulinu představují nejvíce různorodou část mezi izotypy obou molekul. Vždy se nacházejí na povrchu mikrotubulů, kde se účastní vazby proteinů. Post-translační modifikace dotváří variabilitu C-konců. Nemodifikovaný, tj. tyrozinovaný, C-konec α-tubulinu může být zkrácen o jednu aminokyselinu (detyrozinovaná varianta), o dvě (Δ2 varianta) nebo o tři aminokyseliny (Δ3 varianta), nebo může být modifikovaný přidáním polyglutamátového nebo polyglycinového postranního řetězce. Rodina tubulin tyrozin ligáz-podobných proteinů (tubulin tyrosine ligase-like, TTLL) má 14 členů, kteří se podílejí na glutamylaci, glycylaci a tyrozinaci tubulinu. Glutamylázy vykazují dvě odlišné aktivity, iniciaci a elongaci polyglutamátových řetězců. Iniciázy váží první molekulu glutamové kyseliny na γ-karboxylovou skupinu některého z glutamátů, který je součástí neuspořádaného C-konce tubulinu, čímž C-konec rozvětvují. Elongázy rozpoznávají toto rozvětvení a...
α-tubulin is an essential protein for every eukaryotic cell. Together with β-tubulin, it polymerises into microtubules and participates thus in creating and maintaining cellular structures and presents a cell-wide interaction platform for a plethora of microtubule associating proteins. Primary sequences of the disordered C-termini of both α- and β-tubulin are the least conserved among tubulin isotypes and their variability is further increased by the presence of various post-translational modifications. The genetically coded, tyrosinated C-terminus of α-tubulin can be either shortened by one, two or three amino acids resulting in detyrosinated, Δ2, or Δ3 variants, respectively or it can be extended by the addition of polyglutamate or polyglycine chains. The tubulin tyrosine ligase-like (TTLL) protein family consists of 14 enzymes that participate in tubulin glutamylation, glycylation, and tyrosination. The glutamylases have two distinct activities, initiation and elongation of the polyglutamate chain. Initiases link the first glutamate residue to the γ-carboxyl group of one of the glutamates of tubulin C-termini to create a fork in the amino acid sequence. Elongases then recognise the branching glutamate and build up the polyglutamate sidechain one residue at the time. TTLL11 is an elongase of...
Citace dokumentu
Metadata
Show full item recordRelated items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
New regulatory mechanisms of microtubule nucleation
Defence status: DEFENDEDČernohorská, Markéta (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2016)Date of defense: 19. 5. 2016MT nucleation from γ-tubulin complexes, located at centrosome, is an essential step in the formation of MT cytoskeleton. In mammalian cells, -tubulin is encoded by two genes. We functionally characterized two γ-tubulin ... -
Úloha autofagie a vybraných izotypů beta-tubulinu v rezistenci k taxanům u nádorových linií prsu
Defence status: DEFENDEDKábelová, Adéla (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2015)Date of defense: 16. 9. 2015Rezistence nádorových buněk je jednou z častých příčin selhání terapie maligního onemocnění prsu. Cílem této diplomové práce bylo přispět k objasnění mechanismů nádorové rezistence k taxanům, které se běžně užívají v terapii ... -
Rostlinný tubulinový kód
Defence status: DEFENDEDNičová, Klára (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2020)Date of defense: 9. 7. 2020Microtubules, which are made of polymers of α- and β-tubulin, are an integral part of the cytoskeleton. Both types of tubulin share a considerable sequential homology across eukaryotic organisms. Tubulins are encoded by ...