Asociace vybraných polymorfismů hodinových genů s fenotypem vyhraněného chronotypu

Abstract

Cirkadiánní systém se u organismů vyvinul jako adaptace na periodické změny prostředí. Jeho úlohou je zajistit pravidelnou synchronizaci mezi solárním cyklem a vnitřní periodou organismu, a generovat signály, kterými jsou synchronizovány behaviorální a fyziologické procesy v těle se solárním cyklem. Celý mechanismus probíhá na úrovni buňky, kde dochází k pravidelným oscilacím transkripčně translačních smyček hodinových genů během 24 hodin, čímž je zajištěn pravidelný rytmus organismu. Cirkadiánní systém však u lidí nemusí generovat stejně dlouhou periodu a může se lišit v míře synchronizace s vnějším cyklem. V důsledku toho dochází ke vzniku tzv. individuálních časových preferencí. Tyto odlišné preference se označují jako chronotypy, které se dělí do pěti kategorií: extrémně večerní, mírně večerní, nevyhraněný, mírně ranní a extrémně ranní typ. Za jednu z možných příčin těchto odlišností jsou považovány polymorfismy hodinových genů. Asociace vybraných polymorfismů hodinových genů s extrémními chronotypy je předmětem této diplomové práce. Od dobrovolníků s extrémními chronotypy jsme získali vzorek slin pro izolaci DNA. Využitím molekulárních metod PCR, restrikční štěpení a sekvenace jsme provedli genotypizaci vybraných polymorfismů hodinových genů Bmal1, Clock, Per2 a Per3. Statistické a korelační...

The circadian system has evolved in organisms as an adaptation to periodic changes in the environment. Its task is to ensure regular entrainment between the solar cycle and the internal period of the organism, and to generate signals that synchronize behavioral and physiological processes in the body with the solar cycle. The whole mechanism takes place at the cell level, where there are regular oscillations of the transcriptional translation loops of the clock genes occur within 24 hours, thus ensuring a regular rhythm of the organism. However, the circadian system may not generate the same length of period in humans and may differ in the degree of entrainment with the external cycle. Base on that there are developed so-called individual time preferences. These different preferences are referred to as chronotypes, which fall into five categories: extremely evening, moderate evening, intermediate, moderate morning, and extremely morning type. Clock gene polymorphisms are considered to be one of the possible causes of these differences. The association of selected clock gene polymorphisms with extreme chronotypes is the subject of this diploma thesis. We obtained a saliva sample for DNA isolation from volunteers with extreme chronotypes. Using molecular methods of PCR, restriction digest and...