Analýza buněčné signalizace zprostředkované adaptérovým proteinem Daxx
Analysis of cell signaling mediated by the adapter protein Daxx
dissertation thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/1191Identifiers
Study Information System: 145818
Collections
- Kvalifikační práce [20304]
Author
Advisor
Referee
Forstová, Jitka
Stopka, Tomáš
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
-
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
15. 12. 2016
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Pass
Keywords (Czech)
Daxx, transkripce, apoptóza, signalizace, interagující proteiny, buněčný stresKeywords (English)
Daxx, transcription, apoptosis, signaling, interacting proteins, cellular stress1 Abstrakt Multifunkční protein Daxx se jako adaptér či histonový chaperon podílí na značném množství buněčných pochodů zahrnujících regulaci apoptotické či stresové signalizace, antivirové odpovědi, transkripce a dalších pochodů spojených s chromatinem. Procesy, které souvisejí s chromatinem, Daxx ovlivňuje pomocí své interakce s DNA-metyltrans- ferázou-1, histondeacetylázami a s ATPázou remodelující chromatin ATRX. V kom- plexu s ní Daxx působí jakožto histonový chaperon pro histon-3.3, důležitý pro udržo- vání konstitutivního heterochromatinu například v oblasti centromer a telomer. Hlavním cílem této dizertační práce byla hlubší analýza buněčných funkcí proteinu Daxx za pomoci identifikace a funkční charakterizace nových proteinů, které s ním in- teragují. K jejich vyhledání byl použit kvasinkový dvojhybridní systém a výsledkem byla identifikace několika nových interagujících proteinů, převážně jaderných a spoje- ných zejména s regulací chromatinu. Detailněji byla analyzována interakce proteinu Daxx s ATPázou remodelující chromatin Brg1. Ta byla potvrzena jak in vitro, tak i v ži- vých buňkách, kde spolu oba proteiny nejvíce asociovaly v komplexech s vyšší relativní molekulovou hmotností. Tyto předpokládané remodelační komplexy obsahovaly vedle Brg1 i další s ním asociované faktory (BAF)....
2 Abstract Multifunctional adapter protein and histone chaperone Daxx has been described in nu- merous cellular processes, including the regulation of apoptotic and stress signalling, antiviral response and processes connected to chromatin (e. g. transcription). Its influ- ence on chromatin-related processes is mainly carried out by several associated en- zymes, such as DNA-methyltransferase-1, histone deacetylases and chromatin- remodelling ATPase ATRX. In the complex with ATRX Daxx functions as a chaperone of histone-3.3, maintaining the constitutive heterochromatin e. g. at centromeric and telomeric regions. The main aim of this Thesis was a better understanding of the Daxx cellular functions through identification and functional characterization of its novel interacting proteins. Using the yeast two-hybrid screen, several such new Daxx-interacting proteins were identified. These proteins were mainly nuclear, connected to the regulation of chroma- tin-related processes. More detailed analysis focused on the interaction of Daxx with chromatin-remodelling ATPase Brg1. This interaction was confirmed both in vitro and in the cells, where Daxx and Brg1 associated mainly in high molecular weight pro- tein complexes. These likely chromatin-remodelling complexes contain, in addition to Brg1, several...