Changes in domain organization of the plasma membrane in the stress response
Změny doménového uspořádání plasmatické membrány v odpovědi na stres
dissertation thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/116602Identifiers
Study Information System: 129913
Collections
- Kvalifikační práce [19062]
Author
Advisor
Referee
Zimmermannová, Olga
Cvačková, Zuzana
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
-
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
3. 2. 2020
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Pass
Keywords (Czech)
plasmatická membrána, membránové mikrodomény, stresová odpověďKeywords (English)
plasma membrane, membrane microdomains, stress responseMCC/eisosomy jsou mikrodomény kvasinkové plasmatické membrány. MCC/eisosomy vnímají změny extracelulárních a intracelulárních podmínek a aktivují důležité signální dráhy, které odpovídají na stres. V této studii jsme zkoumali funkci MCC/eisosomů za podmínek chronického nedostatku glukózy. Ukázali jsme, že za těchto podmínek MCC/eisosomy regulují degradaci mRNA. Konkrétně, sekvestrace evolučně konzervované exoribonukleázy Xrn1 na MCC/eisosomech vede ke snížení její enzymatické aktivity. Modulace enzymatické aktivity pomocí lokalizace enzymu může představovat nový a efektivní způsob regulace biochemických drah. Naše výsledky také naznačují, že MCC protein Nce102 může hrát úlohu ve fúzi vakuol a v degradaci lipidových partikulí. Odhalili jsme, že dlouhodobý nedostatek glukózy indukuje translokaci proteinu Nce102 z MCC mikrodomény do vakuolárních membránových mikrodomén bohatých na steroly. Mutanty, kterým chybí protein Nce102 a jeho funkční homolog Fhn1, vykazují signifikantní zpoždění v maturaci vakuol a v turnoveru markeru lipidových partikul, proteinu Erg6. Funkce MCC/eisosomů v stresové odpovědi jsou zdokumentované ve velkém množství kvasinkových druhů. Podobně jako funkce těchto mikrodomén jsou i jednotlivé proteinové komponenty MCC/eisosomů evolučně konzervované. Abychom hlouběji...
MCC/eisosomes are yeast plasma membrane microdomains that respond to changes in both extracellular and intracellular conditions and activate important stress-related signaling pathways. In this study, we investigated the function of MCC/eisosomes under the conditions of chronic glucose depletion. We found that MCC/eisosomes regulate mRNA decay under these conditions. Specifically, we demonstrated that the sequestration of the evolutionarily conserved Xrn1 exoribonuclease at MCC/eisosomes leads to the attenuation of its enzymatic activity. Modulation of activity by the enzyme localization may represent a novel and effective mechanism in regulation of biochemical pathways. Moreover, our results suggested that an MCC protein Nce102 might play a role in vacuolar fusion and lipid droplets degradation. We demonstrated that prolonged chronic glucose depletion induces the translocation of Nce102 from MCC to sterol-enriched microdomains in the vacuolar membrane. Deletion mutants lacking Nce102 and its functional homologue Fhn1 exhibited significant delay in vacuole maturation and in turnover of a lipid droplet marker Erg6. The function of MCC/eisosomes in the stress response have been demonstrated in many fungal species. Similar to the microdomain function, also individual protein components of...