Show simple item record

Functional analysis of phosphoglucosamine mutase GlmM in Streptococcus pneumoniae
dc.contributor.advisorUlrych, Aleš
dc.creatorMühldorfová, Tereza
dc.date.accessioned2019-06-28T09:58:59Z
dc.date.available2019-06-28T09:58:59Z
dc.date.issued2019
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/106857
dc.description.abstractFosfoglukozaminmutáza (GlmM), je enzym biosyntézy buněčné stěny, u kterého byla nedávno prokázána jeho esencialita u Streptococcus pneumoniae. Hlavním cílem této diplomové práce bylo definitivně dokázat esencialitu fosforylace serinových zbytků S99 a S101 enzymu GlmM v podmínkách in vivo, jejíž nezbytnost byla již dříve prokázána nepřímo na základě transformační účinnosti. Pro tento účel jsme vytvořili kmen, který obsahuje dvě kopie genu glmM - jednu s aminokyselinovými záměnami na sledovaných serinových zbytcích umístěnou v nativním lokusu a druhou ektopickou kopii divoké formy genu glmM pod kontrolou inducibilního zinkového promotoru. U tohoto kmene jsme sledovali morfologii, růst i expresi GlmM v prostředí s induktorem i bez něho. Ve všech sledovaných parametrech bylo zřejmé, že bez přidání induktoru ektopické exprese genu glmM nejsou buňky životaschopné, a tedy že esenciální protein GlmM je funkční pouze ve fosforylované formě na S99 a S101. Dále jsme se pokusili lokalizovat tento enzym v buňce S. pneumoniae. GlmM jsme fúzovali s fluorescenční značkou GFP a pomocí fluorescenční mikroskopie jsme prokázali, že se jedná o cytoplazmatický protein. Dalším cílem této práce bylo stanovit třetí neznámé místo fosforylace proteinu GlmM in vitro závislé na proteinkináze StkP. Z kinázové reakce in vitro a následné...cs_CZ
dc.description.abstractPhosphoglucosamine mutase (GlmM), an enzyme taking part in biosynthesis of cell wall, has been recently proven to be essential for Streptococcus pneumoniae. The main goal of this thesis was to prove in vivo that GlmM serine residues S99 and S101 phosphorylation is essential while the necessity of it was already proven indirectly based on transformation efficiency. For this purpose we have prepared a strain with two copies of the glmM gene - the first one with amino acid changes on monitored serine residues located at native locus; and the second ectopic copy of the wild allele of glmM gene under control of inducible zinc promoter. We have observed morphology, growth, and GlmM expression with and without the presence of an inductor. All the observed parameters show that the cells are not viable without ectopic glmM expression, thus the essential protein GlmM is functional only when phosphorylated on S99 and S101 residues. Further, we have attempted to localize the enzyme in the S. pneumoniae cell. We have fused GlmM with fluorescent marker GFP and by using the florescent microscopy we have proved that GlmM is cytoplasmic protein. Another goal of this thesis was to find an unknown third phosforylation site of the GlmM protein which is dependent on the protein kinase StkP. From in vitro kinase assay and...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectphosphoglucosamine mutaseen_US
dc.subjectGlmMen_US
dc.subjectStreptococcus pneumoniaeen_US
dc.subjectfosfoglukozaminmutázacs_CZ
dc.subjectGlmMcs_CZ
dc.subjectStreptococcus pneumoniaecs_CZ
dc.titleStudium funkce fosfoglukozaminmutázy GlmM u Streptococcus pneumoniaecs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2019
dcterms.dateAccepted2019-06-07
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId172854
dc.title.translatedFunctional analysis of phosphoglucosamine mutase GlmM in Streptococcus pneumoniaeen_US
dc.contributor.refereeLišková, Petra
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineMikrobiologiecs_CZ
thesis.degree.disciplineMicrobiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Genetics and Microbiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csMikrobiologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enMicrobiologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csFosfoglukozaminmutáza (GlmM), je enzym biosyntézy buněčné stěny, u kterého byla nedávno prokázána jeho esencialita u Streptococcus pneumoniae. Hlavním cílem této diplomové práce bylo definitivně dokázat esencialitu fosforylace serinových zbytků S99 a S101 enzymu GlmM v podmínkách in vivo, jejíž nezbytnost byla již dříve prokázána nepřímo na základě transformační účinnosti. Pro tento účel jsme vytvořili kmen, který obsahuje dvě kopie genu glmM - jednu s aminokyselinovými záměnami na sledovaných serinových zbytcích umístěnou v nativním lokusu a druhou ektopickou kopii divoké formy genu glmM pod kontrolou inducibilního zinkového promotoru. U tohoto kmene jsme sledovali morfologii, růst i expresi GlmM v prostředí s induktorem i bez něho. Ve všech sledovaných parametrech bylo zřejmé, že bez přidání induktoru ektopické exprese genu glmM nejsou buňky životaschopné, a tedy že esenciální protein GlmM je funkční pouze ve fosforylované formě na S99 a S101. Dále jsme se pokusili lokalizovat tento enzym v buňce S. pneumoniae. GlmM jsme fúzovali s fluorescenční značkou GFP a pomocí fluorescenční mikroskopie jsme prokázali, že se jedná o cytoplazmatický protein. Dalším cílem této práce bylo stanovit třetí neznámé místo fosforylace proteinu GlmM in vitro závislé na proteinkináze StkP. Z kinázové reakce in vitro a následné...cs_CZ
uk.abstract.enPhosphoglucosamine mutase (GlmM), an enzyme taking part in biosynthesis of cell wall, has been recently proven to be essential for Streptococcus pneumoniae. The main goal of this thesis was to prove in vivo that GlmM serine residues S99 and S101 phosphorylation is essential while the necessity of it was already proven indirectly based on transformation efficiency. For this purpose we have prepared a strain with two copies of the glmM gene - the first one with amino acid changes on monitored serine residues located at native locus; and the second ectopic copy of the wild allele of glmM gene under control of inducible zinc promoter. We have observed morphology, growth, and GlmM expression with and without the presence of an inductor. All the observed parameters show that the cells are not viable without ectopic glmM expression, thus the essential protein GlmM is functional only when phosphorylated on S99 and S101 residues. Further, we have attempted to localize the enzyme in the S. pneumoniae cell. We have fused GlmM with fluorescent marker GFP and by using the florescent microscopy we have proved that GlmM is cytoplasmic protein. Another goal of this thesis was to find an unknown third phosforylation site of the GlmM protein which is dependent on the protein kinase StkP. From in vitro kinase assay and...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
thesis.grade.code2


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV