Mechanism of auxin transport across plasma membrane through PIN auxin efflux carriers
Mechanismus přenosu auxinu přes plazmatickou membránu prostřednictvím proteinů PIN
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/91276Identifiers
Study Information System: 116810
Collections
- Kvalifikační práce [20356]
Author
Advisor
Referee
Nodzynski, Tomasz
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Experimental Plant Biology
Department
Department of Experimental Plant Biology
Date of defense
5. 9. 2017
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
proteiny PIN, auxin, transport auxinu, cílená mutagenezeKeywords (English)
PIN proteins, auxin, auxin transprot, site directed mutagenesisFytohormon auxin a jeho směrovaná distribuce hraje důležitou roli v regulaci mnoha procesech během vegetativního a reproduktivního vývoje rostlin. Regulace exprese, lokalizace a aktivity proteinů PIN-formed (PIN) je důležitá pro správný transport auxinu v rostlinných pletivech. Proteiny PIN byly popsány jako hlavní přenašeče auxinu z buněk regulující směrovaný tok auxinu. Vytvořené gradienty auxinu dávají jednotlivým částem rostliny informaci o koordinaci vývoje. Predikovaná topologie a struktura proteinů PIN je dodnes nedostatečně popsána a neumožnuje správné pochopení transportního mechanismu. Experimentální analýza domén proteinů PIN může pomoci pochopit jejich úlohu ve zprostředkování transportu auxinu. Cílem této práce bylo upravit C-terminální části proteinů PIN a poodhalit tak existenci pravděpodobných funkčních domén, které jsou zodpovědné za transport auxinu. Systém transientně transformované buněčné linie tabáku Bright Yellow-2 (BY-2) byl použit pro sledování rozdílů v transportní aktivitě jednotlivých PIN proteinů. Tento přístup umožnil nepřímo sledovat množství auxinu v BY-2 buňkách pomocí DR5 reportérového systému. Tranzientně exprimované PIN proteiny navodily snížení intracelulárního auxinu, na které nepřímo poukázalo snížení signálu DR5rev::mRFP. Tranzientně exprimované modifikované...
Phytohormone auxin and its directional distribution plays an essential role in the regulation of numerous processes during vegetative and reproductive plant development. Regulation of the expression, localization and activity of the PIN-FORMED (PIN) proteins is important for proper polar auxin transport in plant tissues. PIN proteins have been described as the major auxin efflux carriers regulating auxin's directional flow to build up gradients that provide information for the coordination of plant development. PIN protein structure topology prediction through bioinformatic analysis is still insufficient to understand their transport mechanism. Experimental analysis of PIN protein domains can provide valuable insight into understanding their role in mediating auxin transport. In this study, the C-terminal part of PINs have been modified by gradual trimming to determine the existence of relevant functional domains, which could be important for auxin transport. Seven modified PIN proteins from Arabidopsis thaliana and Nicotiana tabacum were prepared. Transiently transformed tobacco cell line Bright Yellow-2 (BY-2) was used to monitor differences in PIN transport activity. This approach allowed indirect monitoring of intracellular auxin levels using the DR5 reporter system. Transiently expressed...
Citace dokumentu
Metadata
Show full item recordRelated items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Nové poznatky v metabolismu auxinu
Defence status: DEFENDEDHelusová, Lenka (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2020)Date of defense: 9. 7. 2020Auxin je nejdéle známý fytohormon s mnoha funkcemi. Podílí se na vývoji zárodku, vegetativním i generativním vývoji, reakci rostlin na stres, a též na jejich senescenci a smrti. Aktivita auxinu v rostlinných buňkách a ... -
Mechanismy transmembránového transportu auxinu v širším evolučním kontextu.
Defence status: DEFENDEDRubešová, Magdaléna (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2023)Date of defense: 12. 9. 2023Auxin, represented by the molecule indole-3-acetic acid (IAA), is one of the main phytohormones involved in the regulation of plant development. Its intercellular transport establishes concentration gradients in individual ... -
Characterization of factors participating in regulation of intracellular dynamics of auxin carriers
Defence status: DEFENDEDLacek, Jozef (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2023)Date of defense: 24. 3. 2023Souhrn U rostlin je známo že mají schopnost nasměrovat svoje části, jak prýt, tak kořeny, pro zabezpečení maximálního zisku energie a příjmu živin, ale taky pro možnost vyhnout se toxickým podmínkám pro svůj růst. Regulace ...