Diverzita sekvencí mtDNA a genetická struktura východoafrického sahelu

Abstract

Východoafrický sahel hrál v minulosti důležitou roli jako obousměrný koridor nejen horizontálně, ale i vertikálně migrujících populací. I díky tomu je zde možné pozorovat vysokou genetickou, etnolingvistickou i kulturní diverzitu. Tato diplomová práce se soustředí na genetickou strukturu a migrační aktivitu východního sahelu na základě analýzy HVS-I a HVS-II segmentu mtDNA. Pro analýzu byly vybrány zástupci tří afrických jazykových rodin a různých subsistenčních strategií. Porovnávány byly i populace původem z Arabského poloostrova. Výsledky vypovídají o vysoké genetické diverzitě především u populací východního Súdánu a Afrického rohu, což je spojeno se šířením arabských populací podél údolí řeky Nil. Zdá se, že zde na rozložení genetické diverzity mají jazykové faktory větší vliv než geografické. Odlišná situace byla pozorována u populací Čadu, kde geograficky si blízké populace různého lingvistického zařazení vykazovaly nízkou genetickou diferenciaci. Intra- populační analýzy vypovídají o významném vlivu genetického driftu u pasteveckých populací žijících při africkém pobřeží Rudého moře Bedžů a Rašajdů. U Bedžů je nejspíš podmíněn poklesem velikosti efektivní populace, u Rašajdů je dán efektem zakladatele při jejich recentní imigraci z Arabského poloostrova. Pastevecká populace Baggarů se svým...

Eastern part of the African Sahel, connecting sub-Saharan Africa with North and East Africa, play an important role as a bidirectional corridor for vertically and horizontally migrations of populations. It is the strategic region to study human genetic diversity due to the presence of ethnically, linguistically, culturally and geographically diversity. This work is focused on the analysis of HVS-I and HVS-II segments of mtDNA. The work provides new information about genetic structure and migration activity of this region by analysis twelve populations belonging to three African linguistic families and different subsistent strategies. Analysis of mtDNA revealed the higher diversity of the populations of east Sudan and Horn of Africa, which is connected with the spreading of populations along the Nile River. It seems, that in this region linguistic factors have bigger impact on genetic diversity then the geografic ones. The opposite situation is observed in populations of Chad, where populations with similiar geografic location and different linguistic affilation revealed low genetic differentiation. The intra-population analysis shows the significant influence of genetic drift on the pastoralists living on the Red Sea Coast - Beja and Rashaida. In Beja is probably due to decrease of size of...