Význam dlouhých nekódujících RNA v rostlinách

Abstract

Dlouhé nekódující RNA (lncRNA) jsou transkripty o délce větší než 200nukleotidů s nízkým kódujícím potenciálem. Jedná se o skupinu regulačních ribonukleových kyselin (RNA) zatím v raném stádiu poznání, nicméně s potenciálně širokou rolí napříč organismy a biologickými procesy. U živočichů bylo popsáno několik regulačně významných lncRNA a jejich význam roste mimo jiné i v souvislost s mnohými nádorovými onemocněními. Přestože mnohé dlouhé nekódující transkripty byly odhaleny, jejich konkrétní mechanizmy působení zůstávají neznámé. U rostlin se výzkum soustředí převážně na ekonomicky a zemědělsky významné plodiny jako je rýže, kukuřice nebo sója. Jedná se ale zatím jen o omezené množství experimentálně ověřených transkriptů. Nicméně se zdokonalováním sekvenačních a bioinformatických metod začíná být významnost role lncRNA v mnohých biologických procesech (např. rozmnožování či rostlinné rezistenci k patogenům) naprosto zjevná. Tato bakalářská práce shrnuje dosavadní znalosti o dlouhých nekódujících ribonukleových kyselinách (lncRNA) s důrazem na jejich roli v rostlinách a taktéž se detailněji zabývá současnými problémy a nastiňuje budoucí potenciál výzkumu lncRNA.

Long non-coding RNAs (lncRNAs) represent a group of transcripts with length greater than 200 nucleotides having low coding potential. It is a group of regulatory ribonucleic acid (RNA) still not fully understood but with significant potential in many biological processes across different species. For animals, many important lncRNA regulators and their roles in a range of events including their involvement in carcinogenic diseases have been reported. However, particular mechanisms of functions are often yet to be discovered. Considering plants, economically important species such as rice, maize or soybean are of particular interest. There are still only several fully annotated transcripts. However, with the constant improvement of sequencing and bioinformatic methods, the importance of lncRNA (for example in pathogen resistance or plant reproduction) becomes clear. This bachelor thesis reviews up-to-date knowledge about lncRNAs and their roles in plants. It also describes the difficulties of lncRNA research and discusses their future potential.