Analýza videa pro entomologii
Video analysis for entomology
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/86117Identifikátory
SIS: 189732
Kolekce
- Kvalifikační práce [10679]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Schier, Jan
Fakulta / součást
Matematicko-fyzikální fakulta
Obor
Obecná informatika
Katedra / ústav / klinika
Katedra softwaru a výuky informatiky
Datum obhajoby
20. 6. 2017
Nakladatel
Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
analýza videa, drosophila, sledování objektůKlíčová slova (anglicky)
video analysis, drosophila, object trackingAnalýza vzorců chování jedinců druhu Drosophila melanogaster je předmě- tem studia mnoha laboratořích. Sleduje se chování jedinců například v různých genových liniích. K tomu, aby byla tato analýza možná, je potřeba mít zařízení, které je schopné mušky sledovat a poskytnout o nich strojově čitelné informace. Tyto údaje jsou výstupem vyvinutého trasovacího programu FlyCatcher, který zaznamenává pozice sledovaných objektů. Díky tomu můžeme určit polohu, rych- lost vzájemné postavení jedinců a další parametry. FlyCatcher je postaven na využití knihovny AForge, která slouží ke zpracování multimediálních souborů. FlyCatcher umožňuje zpracování videí pořízených v laboratoři a poskytnutí vý- stupů ve formátu .csv. Tento formát je nadále zpracováván externími statistic- kými programy.
Analysis of behavioral patterns of Drosophila Melanogaster species is a sub- ject of study of many laboratories. The behavior of individuals, for example in different gene lines, is monitored. In order for this analysis to be possible, it is necessary to have a device that is capable of tracking the fly and providing machine-readable data about them. These data are the output of a trace pro- gram FlyCatcher, which records the positions of the observed objects. Thanks to this, we can determine the location, the mutual position of individuals and other parameters. FlyCatcher is based on the use of the AForge library which handles multimedia files. FlyCatcher lets us process videos made in the lab and provide outputs in the .csv format. This format is further processed by external statistical programs.