Doménová struktura a funkce primárních faktorů sigma u bakterií
Domain structure and function of primary bacterial sigma factors
bachelor thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/85530Identifiers
Study Information System: 186370
Collections
- Kvalifikační práce [15867]
Author
Advisor
Referee
Roučová, Kristina
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Biology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
5. 6. 2017
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
RNA polymeráza, primární faktory σ, transkripce, bakterie, Bacillus subtilis, Escherichia coli
Keywords (English)
RNA polymerase, primary σ factors, transcription, bacteria, Bacillus subtilis, Escherichia coli
Iniciace transkripce patří ke stěžejním krokům genové exprese. Přepis genetické informace z DNA do RNA zajišťuje vícepodjednotkový enzym RNA polymeráza (RNAP). Avšak samotná RNAP není schopná rozpoznat specifický promotor a iniciovat transkripci. K tomuto účelu slouží bakteriím protein zvaný faktor σ, který se na RNAP váže a spolu tvoří holoenzym RNAP. V této práci popisuji mechanismus bakteriální transkripce a dále stavbu, funkci a regulaci faktorů σ. Zaměřuji se hlavně na primární faktory σ u dvou významných modelových druhů, a to u gramnegativní Escherichia coli a grampozitivního Bacillus subtilis. Popisuji je v kontextu s alternativními faktory σ a poukazuji na jejich vzájemné odlišnosti ve struktuře, funkci a regulaci. Klíčová slova: RNA polymeráza, primární faktory σ, transkripce, bakterie, Bacillus subtilis, Escherichia coli
Transcription initiation is one of the crucial steps of gene expression. A multisubunit enzyme RNA polymerase (RNAP) transcribes the genetic information from DNA to RNA. However, RNAP itself is unable to recognize a specific promoter and initiate transcription. For this purpose, bacteria have a protein called σ factor, which binds to RNAP and together form the RNAP holoenzyme. In this thesis I describe the mechanism of bacterial transcription and the structure, function and regulation of σ factors. I focus mainly on the primary σ factors of two important model species, namely gramnegative Escherichia coli and grampositive Bacillus subtilis. I describe them in the context of alternative σ factors, and I point out their differences in structure, function and regulation. Key words: RNA polymerase, primary σ factors, transcription, bacteria, Bacillus subtilis, Escherichia coli