Genetická determinace diabetu druhého typu, analýza vybraných genů - THADA, MAEA, JAZF1 a ARAP1

Abstract

Úvod: Diabetes mellitus druhého typu (T2DM) je celosvětově rozšířené civilizační onemocnění, jehož prevalence neustále narůstá. Ačkoli je pravděpodobnost jeho manifestace spojována především s environmentálními faktory, i genetické předpoklady hrají významnou roli. Cílem naší práce bylo zjistit souvislost 4 polymorfismů s rizikem vzniku T2DM u české populace. Polymorfismy rs10203174 THADA, rs6819243 MAEA, rs849135 JAZF1 a rs1552224 ARAP1 (CENTD2) jsme vybrali na základě jejich rizikovosti v britské populaci. Metodika: Studovali jsme skupiny celkem 712 českých pacientů s T2DM a 752 zdravých kontrol, vybraných jako náhodný vzorek české populace ve studii post-MONICA. Genotypizace rs10203174 a rs6819243 probíhala analýzou PCR-RFLP. Analýza genotypů rs849135 a rs1552224 byla provedena pomocí real-time PCR. Výsledky byly analyzovány výpočtem odds ratio (OR) a chí-kvadrátu. Výsledky: Pro variantu rs1552224 se podařilo statisticky významně (P = 0,01) prokázat její rizikovost. Hodnota OR pro rizikovou alelu T je 1,37 (95% CI 1,07 - 1,75). U polymorfismů rs10203174, rs6819243 a rs849135 žádná signifikantní závislost s onemocněním nebyla prokázána. Pro rs10203174 je hodnota OR alely C 1,20 (95% CI 0,91 - 1,56, P = 0,20), OR alely T polymorfismu rs6819243 je 1,12 (95% CI 0,71 - 1,77, P = 0,61) a pro rs849135 odpovídá...

Introduction: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a worldwide spread disease of affluence which prevalence has been growing. Although, the probability of its manifestation is being linked above all with environmental factors, genetic susceptibility plays an important role too. The aim of this thesis was to find out the association of four polymorphisms with the risk of T2DM manifestation in Czech population. Polymorphisms rs10203174 THADA, rs6819243 MAEA, rs849135 JAZF1 and rs1552224 ARAP1 (CENTD2) were chosen based on their risk in British population. Methodology: We studied groups of 712 Czech patients with T2DM and 752 healthy controls selected as a random sample of Czech population in the post-MONICA study. For a genotypisation rs10203174 and rs6819243 we used the PCR-RFLP method. For an analysis of genotypes rs849135 and rs1552224 was used the real-time PCR method. The results were analysed via odds ratio (OR) a chi-square test. Results: In case of the rs1552224 variant, the risk was proved with statistical significance (P = 0,01). The value of OR for the risk allele T is 1,37 (95% CI 1,07-1,75). In case of the polymorphisms rs10203174, rs6819243 and rs849135 no significant association with the disease was proved. For rs10203174 the value of OR of the allele C is 1,20 (95% CI 0,91-1,56, P = 0,20), OR of...