Show simple item record

Closer analysis of gene trap line MGT180 and its candidate genes
dc.contributor.advisorSoukup, Aleš
dc.creatorŠnajdrová, Tereza
dc.date.accessioned2017-06-02T11:17:09Z
dc.date.available2017-06-02T11:17:09Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/84089
dc.description.abstractTvorba postranních kořenů umožňuje rostlinám dobývat půdní prostředí, efektivně získávat vodu a minerální látky či tvořit různé biotické interakce. Vznik postranních kořenů je u Arabidopis thaliana vázán na buňky pericyklu, přiléhající ke xylémovým pólům diarchního cévního svazku. Právě na tyto buňky je vázána exprese gene trap linie MGT180. V této práci bylo prokázáno, že expresnímu vzorci MGT180 odpovídá jaderný protein s AT-hook doménou AHL18 (At3g60870), transkripční faktor z genové rodiny, čítající 29 členů. Funkčně ještě tento gen nebyl charakterizován, analýza jednoduchého mutanta ahl18 a několika dalších, příbuzných genů, neprokázala zřetelný fenotypový projev. Byly vytvořeny dvojitě mutantní rostliny, z nichž jedna (E15) měla výrazný fenotypový projev, který byl však patrný zejména v nadzemní části rostliny a neshodoval se s žádným dosud popsaným fenotypem mutace AHL genů. Mezi některými AHL geny byla popsána redundance, nicméně křížení dvou AHL mutantů, ahl18 a ahl28, vedoucí k rostlině E15, odhalilo možnou redundanci těchto dvou proteinů. Translační fúze AHL18:mRUBY a AHL22:mRUBY pod přirozenými promotory by měla odhalit, kde působí tyto dva příbuzné AHL proteiny a zda je jejich působení buněčně autonomní či nikoliv. Klíčová slova Arabidopsis thaliana, postranní kořen, AHL, pericyklcs_CZ
dc.description.abstractRoot branching allows plants to explore rhizosphere, to gain efficiently water, mineral nutrients or enter in various biotic interactions. Initiation of lateral root formation is localized to pericycle cells, flanking the xylem poles of diarch vascular bundle in Arabidopsis thaliana. Right in these pericycle cells, there is the expression pattern of the gene trap line MGT180. In this theseis , I have provided the evidence that the expression pattern of MGT180 is related with AT-HOOK MOTIF CONTAINING NUCLEAR LOCALIZED18 (AHL18; At3g60870). AHL18 belongs to a gene family of 29 transcriptional factors of Arabidopsis. AHL18 has not been functionally characterized yet, the analysis of singlemutant ahl18 and some others revealed no significant phenotype. However, one of doublemutants, E15, showed a significant phenotype. This phenotype was evident mainly in the aboveground part of plants, and was not corresponding to any phenotype of AHL mutation described so far. There is a known redundancy among some AHL genes, confirmed by crossing of ahl18 and ahl28 leading to E15 plant. Translation phusion AHL18-mRUBY and AHL22-mRUBY under native promotors should reveal, where these two related proteins act, and if they fiction in autonomous manner or not. Key words Arabidopsis thaliana, lateral root, AHL, pericycleen_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectArabidopsis thalianacs_CZ
dc.subjectpostranní kořencs_CZ
dc.subjectAHLcs_CZ
dc.subjectpericyklcs_CZ
dc.subjectArabidopsis thalianaen_US
dc.subjectlateral rooten_US
dc.subjectAHLen_US
dc.subjectpericycleen_US
dc.titleBližší charakterizace gene trap linie MGT180 a jejích kandidátních genůcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2015
dcterms.dateAccepted2015-09-14
dc.description.departmentDepartment of Experimental Plant Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra experimentální biologie rostlincs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId143836
dc.title.translatedCloser analysis of gene trap line MGT180 and its candidate genesen_US
dc.contributor.refereeKlíma, Petr
dc.identifier.aleph002029029
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineExperimentální biologie rostlincs_CZ
thesis.degree.disciplineExperimental Plant Biologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra experimentální biologie rostlincs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Experimental Plant Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csExperimentální biologie rostlincs_CZ
uk.degree-discipline.enExperimental Plant Biologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csTvorba postranních kořenů umožňuje rostlinám dobývat půdní prostředí, efektivně získávat vodu a minerální látky či tvořit různé biotické interakce. Vznik postranních kořenů je u Arabidopis thaliana vázán na buňky pericyklu, přiléhající ke xylémovým pólům diarchního cévního svazku. Právě na tyto buňky je vázána exprese gene trap linie MGT180. V této práci bylo prokázáno, že expresnímu vzorci MGT180 odpovídá jaderný protein s AT-hook doménou AHL18 (At3g60870), transkripční faktor z genové rodiny, čítající 29 členů. Funkčně ještě tento gen nebyl charakterizován, analýza jednoduchého mutanta ahl18 a několika dalších, příbuzných genů, neprokázala zřetelný fenotypový projev. Byly vytvořeny dvojitě mutantní rostliny, z nichž jedna (E15) měla výrazný fenotypový projev, který byl však patrný zejména v nadzemní části rostliny a neshodoval se s žádným dosud popsaným fenotypem mutace AHL genů. Mezi některými AHL geny byla popsána redundance, nicméně křížení dvou AHL mutantů, ahl18 a ahl28, vedoucí k rostlině E15, odhalilo možnou redundanci těchto dvou proteinů. Translační fúze AHL18:mRUBY a AHL22:mRUBY pod přirozenými promotory by měla odhalit, kde působí tyto dva příbuzné AHL proteiny a zda je jejich působení buněčně autonomní či nikoliv. Klíčová slova Arabidopsis thaliana, postranní kořen, AHL, pericyklcs_CZ
uk.abstract.enRoot branching allows plants to explore rhizosphere, to gain efficiently water, mineral nutrients or enter in various biotic interactions. Initiation of lateral root formation is localized to pericycle cells, flanking the xylem poles of diarch vascular bundle in Arabidopsis thaliana. Right in these pericycle cells, there is the expression pattern of the gene trap line MGT180. In this theseis , I have provided the evidence that the expression pattern of MGT180 is related with AT-HOOK MOTIF CONTAINING NUCLEAR LOCALIZED18 (AHL18; At3g60870). AHL18 belongs to a gene family of 29 transcriptional factors of Arabidopsis. AHL18 has not been functionally characterized yet, the analysis of singlemutant ahl18 and some others revealed no significant phenotype. However, one of doublemutants, E15, showed a significant phenotype. This phenotype was evident mainly in the aboveground part of plants, and was not corresponding to any phenotype of AHL mutation described so far. There is a known redundancy among some AHL genes, confirmed by crossing of ahl18 and ahl28 leading to E15 plant. Translation phusion AHL18-mRUBY and AHL22-mRUBY under native promotors should reveal, where these two related proteins act, and if they fiction in autonomous manner or not. Key words Arabidopsis thaliana, lateral root, AHL, pericycleen_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra experimentální biologie rostlincs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV