Show simple item record

Studium termodynamických a kinetických parametrů interakcí oligomerních modelů DNK s organokovovými komplexy aktivními v protirakovinné léčbě stanovených metodami kvantové chemie a kombinovanými QM/MM metodami
dc.contributor.advisorBurda, Jaroslav
dc.creatorMatunová, Petra
dc.date.accessioned2017-06-02T05:43:22Z
dc.date.available2017-06-02T05:43:22Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/82676
dc.description.abstractBylo prokázáno, že rutheniové a platinové komplexy jsou aktivní v protirakovi- nové léčbě. Dnes běžně používaná chemoterapeutika mají stále hodně negativních vedlejších účinků, proto je výzkum v této oblasti stále aktuální. První část diplo- mové práce se zabývá studiem cis-[Pt(NH3)2Cl2] (cisplatina, DDP) a čtyř plati- nových komplexů, potenciálních léčiv proti rakovině: PtCl2(diaminocyklohexan), PtCl2(NH3)(cyklohexylamin) (JM118), cis-[PtCl2(NH3)(piperidin)] a trans-[PtCl2(NH3)(thiazol)]. Tyto komplexy jsou studovány v semi-hydratované a plně-hydratované formě. Termodynamické a kinetické parametry reakcí těchto komplexů s guaninem, což je klíčový proces pro zahájení protirakovinné aktivity, jsou studovány QM metodami. Analýzy elektronové hustoty byly provedeny na úrovni B3LYP/6-311++G(2df,2pd) v IEF-PCM modelu. V druhé části práce je studována reakce tzv. 'piano stool' komplexu ruthenia, [Ru(II)(η6 -p-cymen(nalidixová kyselina)(Cl)]+ , nejdříve s guaninem pomocí QM metod a poté s modelem ds-DNA pomocí QM/MM metod. Reakční centrum popisované QM metodami tvoří dva guaniny a Ru(II) komplex. Analýzy ter- modynamických a kinetických parametrů a analýzy elektronových hustot byly provedeny na úrovni B97D/6-31G*. Všechny...cs_CZ
dc.description.abstractIt has been proven that platinum and ruthenium complexes are active in anti- cancer treatment. Nowadays, the common chemotherapeutica have a lot of side effects, therefore, drugs with fewer negative impacts are intensively searched for. The first part of the thesis focuses on the study of cis-[Pt(NH3)2Cl2] (cisplatin, DDP) and four platinum potential anticancer agents PtCl2(diaminocyclohexane), PtCl2(NH3)(cyclohexylamine) (JM118), cis-[PtCl2(NH3)(piperidine)] and trans-[PtCl2(NH3)(thiazole)]. Thermodynamic and kinetic parameters of reac- tions of these complexes in semi-hydrated and fully-hydrated form with guanine were studied using QM methods. The reaction with guanine is the key process ini- tiating the anticancer activity. Analyses of electron density were performed at the B3LYP/6-311++G(2df,2pd) level of theory in IEF-PCM model. The second part of the thesis studies the reaction of the so-called 'piano stool' Ru(II) transition metal complex, [Ru(II)(η6 -p-cymene(nalidixic acid)(H2O)]2+ , first with guanine using QM methods and second with ds-DNA model using QM/MM methods. The reaction site, which is described by QM method, is two consecutive guanines and the Ru(II) complex. Analyses of thermodynamic and kinetic parameters, and electron density were performed at the B97D/6-31G* level of theory. All the...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.subjectTermodynamické potenciálycs_CZ
dc.subjectchemická kinetikacs_CZ
dc.subjectorganokovové komplexycs_CZ
dc.subjectkvantová chemiecs_CZ
dc.subjectTermodynamic potentialsen_US
dc.subjectchemical kineticsen_US
dc.subjectorganometallic complexesen_US
dc.subjectquantum chemistryen_US
dc.titleStudium termodynamických a kinetických parametrů interakcí oligomerních modelů DNK s organokovovými komplexy aktivními v protirakovinné léčbě stanovených metodami kvantové chemie a kombinovanými QM/MM metodamien_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2015
dcterms.dateAccepted2015-09-14
dc.description.departmentDepartment of Chemical Physics and Opticsen_US
dc.description.departmentKatedra chemické fyziky a optikycs_CZ
dc.description.facultyMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Mathematics and Physicsen_US
dc.identifier.repId82885
dc.title.translatedStudium termodynamických a kinetických parametrů interakcí oligomerních modelů DNK s organokovovými komplexy aktivními v protirakovinné léčbě stanovených metodami kvantové chemie a kombinovanými QM/MM metodamics_CZ
dc.contributor.refereeSochorová Vokáčová, Zuzana
dc.identifier.aleph002027304
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiofyzika a chemická fyzikacs_CZ
thesis.degree.disciplineBiophysics and Chemical Physicsen_US
thesis.degree.programFyzikacs_CZ
thesis.degree.programPhysicsen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csMatematicko-fyzikální fakulta::Katedra chemické fyziky a optikycs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Mathematics and Physics::Department of Chemical Physics and Opticsen_US
uk.faculty-name.csMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Mathematics and Physicsen_US
uk.faculty-abbr.csMFFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiofyzika a chemická fyzikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBiophysics and Chemical Physicsen_US
uk.degree-program.csFyzikacs_CZ
uk.degree-program.enPhysicsen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csBylo prokázáno, že rutheniové a platinové komplexy jsou aktivní v protirakovi- nové léčbě. Dnes běžně používaná chemoterapeutika mají stále hodně negativních vedlejších účinků, proto je výzkum v této oblasti stále aktuální. První část diplo- mové práce se zabývá studiem cis-[Pt(NH3)2Cl2] (cisplatina, DDP) a čtyř plati- nových komplexů, potenciálních léčiv proti rakovině: PtCl2(diaminocyklohexan), PtCl2(NH3)(cyklohexylamin) (JM118), cis-[PtCl2(NH3)(piperidin)] a trans-[PtCl2(NH3)(thiazol)]. Tyto komplexy jsou studovány v semi-hydratované a plně-hydratované formě. Termodynamické a kinetické parametry reakcí těchto komplexů s guaninem, což je klíčový proces pro zahájení protirakovinné aktivity, jsou studovány QM metodami. Analýzy elektronové hustoty byly provedeny na úrovni B3LYP/6-311++G(2df,2pd) v IEF-PCM modelu. V druhé části práce je studována reakce tzv. 'piano stool' komplexu ruthenia, [Ru(II)(η6 -p-cymen(nalidixová kyselina)(Cl)]+ , nejdříve s guaninem pomocí QM metod a poté s modelem ds-DNA pomocí QM/MM metod. Reakční centrum popisované QM metodami tvoří dva guaniny a Ru(II) komplex. Analýzy ter- modynamických a kinetických parametrů a analýzy elektronových hustot byly provedeny na úrovni B97D/6-31G*. Všechny...cs_CZ
uk.abstract.enIt has been proven that platinum and ruthenium complexes are active in anti- cancer treatment. Nowadays, the common chemotherapeutica have a lot of side effects, therefore, drugs with fewer negative impacts are intensively searched for. The first part of the thesis focuses on the study of cis-[Pt(NH3)2Cl2] (cisplatin, DDP) and four platinum potential anticancer agents PtCl2(diaminocyclohexane), PtCl2(NH3)(cyclohexylamine) (JM118), cis-[PtCl2(NH3)(piperidine)] and trans-[PtCl2(NH3)(thiazole)]. Thermodynamic and kinetic parameters of reac- tions of these complexes in semi-hydrated and fully-hydrated form with guanine were studied using QM methods. The reaction with guanine is the key process ini- tiating the anticancer activity. Analyses of electron density were performed at the B3LYP/6-311++G(2df,2pd) level of theory in IEF-PCM model. The second part of the thesis studies the reaction of the so-called 'piano stool' Ru(II) transition metal complex, [Ru(II)(η6 -p-cymene(nalidixic acid)(H2O)]2+ , first with guanine using QM methods and second with ds-DNA model using QM/MM methods. The reaction site, which is described by QM method, is two consecutive guanines and the Ru(II) complex. Analyses of thermodynamic and kinetic parameters, and electron density were performed at the B97D/6-31G* level of theory. All the...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta, Katedra chemické fyziky a optikycs_CZ
dc.identifier.lisID990020273040106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV