Studium interakce forkhead transkripčního faktoru FOXO4 s DNA a s proteinem 14-3-3

Abstract

CHARLES UNIVERSITY IN PRAGUE THE FACULTY OF NATURAL SCIENCE Department of Physical and Macromolecular Chemistry The summary of the doctoral thesis Study of interactions of forkhead transcription factor FOXO4 with DNA and the 14-3-3 protein RNDr. Petr Vácha Scientific supervisor: Prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D. Prague 2015 Abstract This doctoral thesis deals with the interaction of human forkhead transcription factor FOXO4 with DNA and regulating 14-3-3 protein respectively. The main aim of this work was detailed characterization of interaction between DNA binding domain of protein FOXO4 with two canonical DNA sequences and further clarifying the role of the 14-3-3 protein in the regulation of activity of protein FOXO4. FOXO transcription factors are potent activators of the transcription of genes, which affect a variety of cellular processes. FOXO4 protein belongs to the family of forkhead transcription factor, which is a group of several tens of proteins, whose common feature is a highly conserved DNA- binding domain. Summary of the DNA binding specificity of these proteins, namely what precisely determines the small differences in the binding properties of individual forkhead proteins, despite the large amount of available structural data remains still unclear. Therefore, detailed characterization of...

UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA Katedra fyzikální a makromolekulární chemie Autoreferát doktorské práce Studium interakce forkhead transkripčního faktoru FOXO4 s DNA a s proteinem 14-3-3 RNDr. Petr Vácha Školitel: Prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D. Praha 2015 Abstrakt Tato doktorská práce se zabývá studiem interakcí lidského forkhead transkripčního faktoru FOXO4 s DNA a s regulačním proteinem 14-3-3. Hlavním cílem této práce byla detailní charakterizace interakce DNA-vazebné domény proteinu FOXO4 se dvěmi kanonickými sekvencemi DNA a dále objasnění úlohy proteinu 14-3-3 v procesu regulace funkce FOXO4. Transkripční faktory FOXO jsou účinnými aktivátory transkripce genů, čímž ovlivňují celou řadu buněčných procesů. Protein FOXO4 patří do rodiny forkhead transkripčních faktorů, což je skupina několika desítek proteinů, jejichž společným znakem je velmi konzervovaná DNA-vazebná doména. Podstata DNA-vazebné specifity těchto proteinů, tedy co přesně determinuje drobné odlišnosti ve vazebných vlastnostech jednotlivých forkhead proteinů, je i přes množství dostupných strukturních dat stále nejasné. Proto byla provedena detailní charakterizace interakcí mezi DNA-vazebnou doménou proteinu FOXO4 a DNA pomocí rezonance povrchového plazmonu (SPR) a časově- rozlišené fluorescenční spektroskopie. Výsledky...