Vývoj chemických regulátorů drah mikroRNA a RNAi
Vývoj chemických regulátorů drah mikroRNA a RNAi
dizertační práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/81314Identifikátory
SIS: 85313
Kolekce
- Kvalifikační práce [19614]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Bařinka, Cyril
Pospíšek, Martin
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
-
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
9. 9. 2015
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Prospěl/a
Klíčová slova (česky)
mikroRNA, RNA interference (RNAi), sekvenčně-specifikcé umlčení RNA (RNA silencing), Dicer, inhibitor, aktivátor, testování s vysokou propustností (HTS)Klíčová slova (anglicky)
microRNA, RNA interference (RNAi), RNA silencing, Dicer, inhibitor, activator, high-throughput screening (HTS)MikroRNA jsou nekódující RNA navozující sekvenčně specifickou inhibici genové exprese na posttranskripční úrovni. MikroRNA představují hlavní skupinu malých endogenních RNA v savčích buňkách. V současnosti je známo více než 2500 lidských mikroRNA, které potencionálně regulují více než 60% lidských genů kódujících proteiny. MikroRNA se účastní většiny buněčných procesů a změny v jejich expresi byly popsány u různých patologií, včetně rakoviny. V současnosti neexistuje žádná malá chemická sloučenina schopná efektivního ovlivnění aktivity dráhy mikroRNA. Nicméně, malé chemické sloučeniny představují skvělé nástroje pro výzkum procesů, ve kterých dráhy sekvenčně specifického umlčování RNA (RNA silencing) hrají roli. Navíc by mohly být využitelné i pro biotechnologické aplikace a mohly by mít i značný terapeutický potenciál. Tato práce je součástí širokého projektu, jehož konečným cílem je: (i) najít soubor malých molekul umožňujících stimulaci a inhibici drah sekvenčně specifického umlčování RNA a (ii) identifikovat případy, kdy se tyto dráhy vzájemně ovlivňují s jiných buněčnými drahami. Tato práce shrnuje výsledky prvních dvou fází projektu, vývoj vysoce výkonných metod testování s vysokou propustností a vysoce výkonné testování s vysokou propustností (high-throughput screening, HTS) dostupných...
MicroRNAs are noncoding RNAs inducing sequence-specific posttranscriptional inhibition of gene expression and represent the major class of small endogenous RNAs in mammalian cells. Over 2,500 of human microRNAs potentially regulating more than 60% of human protein-coding genes have been identified. MicroRNAs participate in the majority of cellular processes, and their expression changes in various diseases, including cancer. Currently, there is no efficient small chemical compound available for the modulation of microRNA pathway activity. At the same time, small chemical compounds represent excellent tools for research of processes involving RNA silencing pathways, for biotechnological applications, and would have a considerable therapeutic potential. The presented work represents a part of a broader project, whose ultimate goal is: (i) to find a set of small molecules allowing for stimulation or inhibition of RNA silencing and (ii) to identify crosstalks between RNA silencing and other cellular pathways. This thesis summarizes results from the first two phases of the project, the development of high-throughput screening assays and the high- throughput screening (HTS) of available libraries of small compounds. To monitor the microRNA pathway activity, we developed and optimized one biochemical...