Housekeeping geny

Abstract

Housekeeping geny jsou geny exprimované ve většině tkání organismu za určitých podmínek daného prostředí. Jejich exprese je pro buňku zpravidla esenciální, částečně neměnná a může probíhat i na nízké úrovni. Rozvoj genomových a transkriptomových analýz přispěl k zpřesnění znalostí o housekeeping genech, jejich struktuře, počtu, intenzitě i stabilitě genové exprese. Housekeeping geny se využívají jako referenční geny pro kalibraci v semi- kvantitativních a kvantitativních studiích v oblasti molekulární biologie. V práci zmíním několik kandidátů, které byly mnoha studiemi určeny jako nejvhodnější referenční geny. Zaměřím se převážně na housekeeping geny u člověka a nejvíce prozkoumaných modelových organismů, Saccharomyces cerevisiae a Arabidopsis thaliana

Housekeeping genes are genes expressed in most tissues of the organism under certain conditions of the environment. Their expression in the cell is essential and relatively stable and may proceed at a low level. The development of genomic and transcriptomic analyses contributed to improving of our knowledge about housekeeping genes, about their structure, number, as well as the intensity and stability of their expression. Housekeeping genes are used as the reference genes for a calibration in semi-quantitative and quantitative studies in molecular biology. In my thesis, I will mention several candidates that have been selected as the most suitable reference genes by many studies. I will focus mainly on human housekeeping genes and the most studied model organisms like Saccharomyces cerevisiae or Arabidopsis thaliana.