Možné přístupy ke genové terapii Cystické fibrosy
Possibel approaches to gene therapy of cystic fibrosis
bachelor thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/80283Identifiers
Study Information System: 168367
Collections
- Kvalifikační práce [20088]
Author
Advisor
Referee
Vaněk, Ondřej
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Biochemistry
Department
Department of Biochemistry
Date of defense
13. 6. 2016
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
cystická fibróza, Western blot, CFTR protein, genová terapie, přenos mRNA, kationtový liposomKeywords (English)
cystic fibrosis, Western blotting, CFTR protein, gene therapy, mRNA transfer, cationic liposome1 Abstrakt Cystická fibróza je autosomálně recesivní onemocnění způsobené mutací v CFTR genu, která má za následek nefunkčnost či absenci CFTR chloridového kanálu. Jeden ze způsobů, jak indukovat tvorbu CFTR proteinu v postižených buňkách, představuje genová terapie. V rámci genové terapie lze do cílových buněk přenášet buď DNA, nebo mRNA. Tato práce byla zaměřena na optimalizaci metody detekce CFTR proteinu pomocí metody Western blot, díky níž byla studována účinnost přenosu CFTR-mRNA do buněčných linií. CFTR protein byl detekován v buněčné linii zdravého plicního epitelu (NuLi-1), plicního epitelu postiženého cystickou fibrózou s mutací ΔF508 (CuFi-1) a v buněčné linii plicního karcinomu (A549). Byla porovnávána účinnost čtyř způsobů buněčné lyze - lyze pomocí ultrazvuku a lyze třemi různými lyzačními pufry. Jako nejúčinnější pro detekci tohoto proteinu se ukázala lyze RIPA pufrem s inhibitory proteas. Zároveň byly porovnávány tři primární monoklonální protilátky pro detekci CFTR proteinu metodou Western blot. Z těchto protilátek se ukázala jako nejvhodnější protilátka CF3, která je specifická proti extracelulárnímu epitopu CFTR proteinu. Byly detekovány různě glykosylované formy CFTR proteinu. Největší množství CFTR protein bylo zjištěno v buněčné linii NuLi-1. Zároveň byl tento protein detekován v...
1 Abstract Cystic fibrosis is an autosomal recesive disorder caused by a mutation in the CFTR gene, which leads to inefficiency or absence of CFTR chlorid channel. One way to induce production of CFTR protein in target cells, is to use gene therapy. The principle od gene therapy is to transfer DNA or mRNA molecules inside malfunctioning cells. The aim of this study was to optimise the detection of CFTR protein using the Western blot analysis. Then, using this method the effectiveness of CFTR-mRNA transfection was studied. To study the CFTR protein, a number of cell lines was used: a healthy human ephitelial cell line (NuLi-1), an ephitelial cell line with ΔF508 mutation (CuFi-1), and a human lung carcinoma cell line (A549). This study compared four different ways of cell lysis - lysis by sonication and lysis by three distinct lysis buffers. Lysis by RIPA buffer with protease inhibitors was determined for the detection of CFTR protein. Moreover, three different primary monoclonal antibodies were also tested. The CF3 antibody, which is specific to an extracellular epitope of CFTR protein, was found able to detect CFTR protein specifically. A couple of different glycosylated forms of CFTR protein was detected. The highest amount of CFTR protein was determined in the NuLi-1 cell line. CFTR protein was also...