Genetic variability of the genus Alburnoides in Azerbaijan
Genetická variabilita rodu Alburnoides v Ázerbájdžánu
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/78765Identifiers
Study Information System: 174734
Collections
- Kvalifikační práce [18438]
Author
Advisor
Referee
Vukićová, Jasna
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Zoology
Department
Department of Zoology
Date of defense
13. 9. 2016
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
Alburnoides, biogeografie, fylogeneze, genetická variabilita, rybyKeywords (English)
Alburnoides, biogeography, fish, genetic variability, phylogenyRegion Kavkazu je charakterizován vysokou úrovní endemizmu a bohatstvím taxonů ryb. Ázerbájdžán je stát, který je situovaný na rozhrání mezi Evropou a Asii, a jeho řeky tečou do Kaspického moře. Přírodní prostředí tohoto státu představují různorodé habitaty s diversifikovanou faunou a daný region je velmi atraktivní také pro biogeografický výzkum, jelikož leží na rozhraní dvou různých ekoregionů. I v současné době stále chybějí podrobné znalosti o sladkovodních rybách z toho regionu. Ouklejky (Alburnoides Jeitteles, 1861, Actinopterygii, Cyprinidae) jsou rodem drobných sladkovodních ryb, které byly vybrány jako objekt výzkumu také kvůli početným objevům a popisům nových druhů z okolních států. Předkládaná práce je jedná z mála molekulárních studií, která se pokouší vyřešit taxonomickou situaci uvnitř rodu Alburnoides, popsat fylogenetické vztahy mezi jednotlivými populacemi a poskytnout biogeografické interpretace pro ichtyofaunu z povodí řek Kaspického moře. V práci byly použity jak mitochondriální (cytochrom b, cytochrom oxidáza podjednotka I) tak i jaderné (RAG1, rodopsin) markery a analýzy maximální věrohodnosti (Maximum Likelihood), maximální parsimonie (Maximum Parsimony) a Bayesovské analýzy byly použité k rekonstrukci fylogenetických a fylogeografických vztahů. Dále byla použita metoda...
The Caucasus region is characterized by high rate of endemism and taxa richness of fishes. Azerbaijan is a country situated on the border between Europe and Asia with rivers flowing in the Caspian Sea. Natural environment of this country is represented by various habitats with diverse ichthyofauna. This region is very attractive for biogeographical studies because it lays on the border of two different ecoregions. Even on the modern stage of scientific cognition, there is still lack of data about freshwater fishes from that region. Spirlins or rifle-minnows (Alburnoides Jeitteles, 1861, Actinopterygii, Cyprinidae) is a genus of small freshwater fishes and it has been chosen as a focus of this thesis because of numerous reports of new species from surrounding countries. The presented thesis is one of the seldom molecular studies trying to reveal the taxonomical situation within the genus Alburnoides, describe the phylogenetic relationships between geographically isolated populations, and provide biogeographical implications for fishes in the Caspian Sea river basins. Both mitochondrial (cytochrome b, cytochrome oxidase subunit I) and nuclear (RAG1, rhodopsin) markers were used in the study and the Maximum Likelihood, Maximum Parsimony and Bayesian phylogenetic analyses were performed. Further, the...