Populace afrického sahelu pohledem fylogeografie euroasijských mtDNA haploskupin

Abstract

Tato diplomová práce zkoumá dvě mtDNA haploskupiny eurasijského původu, jež se vyskytují v převážné míře u Fulbů, pastevců afrického sahelu. Na prvotní analýzu bylo využito 544 vzorků nepříbuzných fulbských jedinců. Tyto vzorky byly klasifikovány na základě hypervariabilního segmentu I (HVS-I) mtDNA do haploskupin a následně byly pro celogenomové sekvenování mtDNA vybrány konkrétní eurasijské haplotypy. Obdržené mito- genomy byly zařazeny do fylogenetických stromů a datovány. Ukázalo se, že patří do haploskupin U5b1b1b a H1ca1a s pravděpodobným původem na Pyrenejském poloostrově, zřejmě ve frankokantaberském refugiu, kde vznikli jejich předkové v pozdním glaciálu až v první polovině holocénu. Ti následně migrovali přes Gibraltarskou úžinu do severní Afriky a na Saharu, kde se utvářela proto-fulbská pastevecká populace. Lze také předpokládat, že jedna její část přišla do Afriky z Blízkého východu společně s hovězím dobytkem. V druhé polovině holocénu migrovala tato pastevecká populace z vysychající Sahary do sahelu. Patrně kvůli malému počtu migrujících žen byly do ní přijaty i ženy z lokálních subsaharských populací, což vysvětluje majoritní zastoupení západoafrických mtDNA haploskupin u dnešních Fulbů. Haploskupiny U5b1b1b a H1ca1a ale již zůstaly izolovány v jejich populaci.

The thesis is focused on two mtDNA haplogroups of Eurasian origin that occur mostly among the Fulani, herders of the African Sahel. On the initial analysis 544 DNA samples from unrelated Fulani individuals were used. These samples were classified to haplogroups according to hypervariable segment I (HVS-I) of mtDNA and subsequently, specific Eurasian haplotypes were chosen for the whole mtDNA genome sequencing. Obtained mito-genomes were assigned to phylogenetic trees and dated. It turned out that they belonged to haplogroups U5b1b1b and H1ca1a with the probable origin in the Iberian Peninsula, presumably in Franco-Cantabrian refugium where their ancestors originated in the period between the Late Glacial and the first half of the Holocene. Afterwards they migrated through the Strait of Gibraltar to North Africa and the Sahara, where the proto-Fulani pastoral population was being formed. It may also be assumed that a part of this population came to Africa from the Near East, along with cattle. In the second half of the Holocene, this pastoral population migrated from the drying Sahara to the Sahel. Probably due to small number of female migrants the females from the local populations were integrated, which explains the major representation of West African mtDNA haplogroups in contemporary Fulani....