Show simple item record

Ramanova optická aktivita biomolekul: od jednoduchých modelů ke komplexním systémům
dc.contributor.advisorBaumruk, Vladimír
dc.creatorPazderková, Markéta
dc.date.accessioned2017-06-01T04:02:50Z
dc.date.available2017-06-01T04:02:50Z
dc.date.issued2016
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/76167
dc.description.abstractPráce je zaměřena na studium specifických projevů disulfidové a neplanární amidové skupiny ve spektrech Ramanovy optické aktivity (ROA) s cílem ukázat, že ROA umožňuje získat informace o konformaci peptidů a proteinů, které je obtížné nebo dokonce nemožné získat pomocí jiných spektroskopických technik. Jako modelové systémy pro studium neplanární amidové vazby jsou použity speciálně navržené malé rigidní molekuly s dobře definovanou strukturou - tricyklické spirodilaktamy. Možnost detekce disulfidové skupiny je studována v ROA spektrech modelových peptidů s jednou až dvěma disulfidovými skupinami, z nichž některé jsou biologicky aktivní (neurohypofyzární hormony a jejich agonistické a antagonistické analogy, antimikrobiální peptid lasiocepsin a jeho analogy s různým disulfidovým přemostěním). Kromě ROA jsou tyto systémy studovány také pomocí komplementárních chiroptických metod - vibračního (VCD) a elektronového (ECD) cirkulárního dichroismu, a to v rozšířeném spektrálním oboru (pod 180 nm) s využitím synchrotronového zdroje (SRCD). Současné využití těchto technik umožňuje získat komplexní informaci o struktuře studovaných molekul. Experimentální chiroptická data jsou dále srovnána s teoretickými ab initio výpočty. V chiroptických spektrech se nám podařilo identifikovat a interpretovat signály...cs_CZ
dc.description.abstractThe aim of the thesis is to utilize Raman optical activity (ROA) to get unique information on peptide/protein conformation, which is otherwise difficult or even impossible to obtain. We have focused on investigation of amide and disulfide groups. Utilizing tailor-made model structures (rigid tricyclic spirodilactams with two interacting nonplanar amide groups), special model peptides and even biologically active molecules (neurohypophyseal hormones and their agonistic and antagonistic analogs, antimicrobial peptide lasiocepsin and its analogs having different disulfide pattern) we have traced specific spectral manifestation of nonplanar amides and disulfides. ROA results were supplemented by data obtained by complementary chiroptical methods - electronic (including vacuum UV - SRCD) and vibrational circular dichroism. When used in a concerted fashion, these techniques provide complex information on peptide/protein secondary structure. Where possible, experimental chiroptical data were compared to ab initio calculations. In chiroptical spectra we have found and interpreted signals reflecting nonplanarity of the amide group. Moreover, in ROA spectra we have identified signals due to S-S stretching vibrations which seem to reflect sense of the disulfide group torsion.en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.subjectRamanova optická aktivitacs_CZ
dc.subjectpeptidy a proteinycs_CZ
dc.subjectdisulfidové můstkycs_CZ
dc.subjectneplanární amidová vazbacs_CZ
dc.subjectRaman optical activityen_US
dc.subjectpeptides and proteinsen_US
dc.subjectdisulfide bridgesen_US
dc.subjectnonplanar amide groupen_US
dc.titleRaman optical activity of biomolecules: From simple models to complex systemsen_US
dc.typerigorózní prácecs_CZ
dcterms.created2016
dcterms.dateAccepted2016-02-19
dc.description.departmentDepartment of Macromolecular Physicsen_US
dc.description.departmentKatedra makromolekulární fyzikycs_CZ
dc.description.facultyMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Mathematics and Physicsen_US
dc.identifier.repId173432
dc.title.translatedRamanova optická aktivita biomolekul: od jednoduchých modelů ke komplexním systémůmcs_CZ
dc.identifier.aleph002072565
thesis.degree.nameRNDr.
thesis.degree.levelrigorózní řízenícs_CZ
thesis.degree.disciplineBiofyzika a chemická fyzikacs_CZ
thesis.degree.disciplineBiophysics and Chemical Physicsen_US
thesis.degree.programFyzikacs_CZ
thesis.degree.programPhysicsen_US
uk.faculty-name.csMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Mathematics and Physicsen_US
uk.faculty-abbr.csMFFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiofyzika a chemická fyzikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBiophysics and Chemical Physicsen_US
uk.degree-program.csFyzikacs_CZ
uk.degree-program.enPhysicsen_US
thesis.grade.csProspělcs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csPráce je zaměřena na studium specifických projevů disulfidové a neplanární amidové skupiny ve spektrech Ramanovy optické aktivity (ROA) s cílem ukázat, že ROA umožňuje získat informace o konformaci peptidů a proteinů, které je obtížné nebo dokonce nemožné získat pomocí jiných spektroskopických technik. Jako modelové systémy pro studium neplanární amidové vazby jsou použity speciálně navržené malé rigidní molekuly s dobře definovanou strukturou - tricyklické spirodilaktamy. Možnost detekce disulfidové skupiny je studována v ROA spektrech modelových peptidů s jednou až dvěma disulfidovými skupinami, z nichž některé jsou biologicky aktivní (neurohypofyzární hormony a jejich agonistické a antagonistické analogy, antimikrobiální peptid lasiocepsin a jeho analogy s různým disulfidovým přemostěním). Kromě ROA jsou tyto systémy studovány také pomocí komplementárních chiroptických metod - vibračního (VCD) a elektronového (ECD) cirkulárního dichroismu, a to v rozšířeném spektrálním oboru (pod 180 nm) s využitím synchrotronového zdroje (SRCD). Současné využití těchto technik umožňuje získat komplexní informaci o struktuře studovaných molekul. Experimentální chiroptická data jsou dále srovnána s teoretickými ab initio výpočty. V chiroptických spektrech se nám podařilo identifikovat a interpretovat signály...cs_CZ
uk.abstract.enThe aim of the thesis is to utilize Raman optical activity (ROA) to get unique information on peptide/protein conformation, which is otherwise difficult or even impossible to obtain. We have focused on investigation of amide and disulfide groups. Utilizing tailor-made model structures (rigid tricyclic spirodilactams with two interacting nonplanar amide groups), special model peptides and even biologically active molecules (neurohypophyseal hormones and their agonistic and antagonistic analogs, antimicrobial peptide lasiocepsin and its analogs having different disulfide pattern) we have traced specific spectral manifestation of nonplanar amides and disulfides. ROA results were supplemented by data obtained by complementary chiroptical methods - electronic (including vacuum UV - SRCD) and vibrational circular dichroism. When used in a concerted fashion, these techniques provide complex information on peptide/protein secondary structure. Where possible, experimental chiroptical data were compared to ab initio calculations. In chiroptical spectra we have found and interpreted signals reflecting nonplanarity of the amide group. Moreover, in ROA spectra we have identified signals due to S-S stretching vibrations which seem to reflect sense of the disulfide group torsion.en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta, Katedra makromolekulární fyzikycs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 3-5, 116 36 Praha; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV