Fylogeografie rejska horského, Sorex alpinus (Soricidae, Mammalia)
Phylogeography of the Alpine shrew, Sorex alpinus (Soricidae, Mammalia)
rigorous thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/75372Identifiers
Study Information System: 180542
Collections
- Kvalifikační práce [20130]
Author
Referee
Horáček, Ivan
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Zoology
Department
Department of Zoology
Date of defense
17. 10. 2016
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Pass
Rejsek horský (Sorex alpinus Schinz, 1837) je drobný zástupce čeledi Soricidae, který se vyskytuje v horských lesích střední a jihovýchodní Evropy. Jeho ostrůvkovitý areál rozšíření zahrnuje Alpy, severozápadní pohoří Balkánu, Karpaty a izolované oblasti v Německu, České republice a Polsku. Tento disjunktní areál rozšíření rejska horského je považován za následek areálové dynamiky druhu spojené s pleistocenními oscilacemi klimatu. Cílem této práce bylo prozkoumat fylogeografickou strukturu rejska horského v oblasti střední a jižní Evropy. K odhalení genetické struktury populací rejska horského byla použita sekvence hypervariabilní domény mitochondriální kontrolní oblasti. Bylo zpracováno 51 vzorků z 18 lokalit zahrnujících většinu areálu rozšíření druhu. Výsledný dataset sekvencí byl analyzován pomocí metod populační a landscape genetiky. Výsledky ukázaly mělkou mitochondriální genealogii s diferenciací mezi haploskupinami. To společně s demografickou analýzou naznačuje populační nárůst podporující hypotézu o expanzi rejska horského během ledových dob. Po skončení poslední doby ledové následovala fragmentace areálu rejska a jeho ústup do vyšších nadmořských výšek a vytvoření reliktních populací. Klíčová slova: rejsci, d-loop, landscape genetika, genetická struktura
The Alpine shrew (Sorex alpinus Schinz, 1837) is a small member of family Soricidae, which is found in mountain forests of central and south Europe. Its patchy range includes the Alps, the NW Balkans, the Carpathians, and some isolated mountain areas in Germany, Czech Republic and Poland. The disjunct range of Alpine shrew presumably results from range dynamics of the species connected with Pleistocene climate oscillation. The aim of this study was to investigate phylogeographical structure of the Alpine shrew in the central and SE European mountain systems. To examine genetic structure of Alpine shrew populations the hypervariable domain of the mitochondrial control region was used. We processed 51 samples from 18 localities, covering the majority of the distributional area of the species. Final sequence dataset was analyzed using population and landscape genetic approaches. Results revealed shallow mitochondrial genealogy with differentiation among haplogroups. This pattern, together with demographic analyses suggest population expansion, corroborated with the hypothesis that during glacial periods the Alpine shrew expanded. End of the last ice period was followed by fragmentation of the species range and its retreat to higher elevations and formation of relict populations. Key words: shrews,...