Studium pohybu polyomavirů z pozdního endozómu směrem k buněčnému jádru
Studies of polyomavirus trafficking from late endosomes towards the cell nucleus
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/74551Identifiers
Study Information System: 159402
Collections
- Kvalifikační práce [17926]
Author
Advisor
Referee
Němečková, Šárka
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Genetics, Molecular Biology and Virology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
13. 9. 2016
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
myší polyomavirus, retrográdní transport, Brefeldin A, Golgicid A, kolokalizace, trans-Golgi síťovina, COPI, Rab9Keywords (English)
mouse polyomavirus, retrograde transport, Brefeldin A, Golgicide A, colocalization, trans-Golgi network, COPI, Rab9Myší polyomavirus (MPyV) je modelovým virem čeledi Polyomaviridae. Polyomaviry jsou malé neobalené DNA viry. U imunosuprimovaných pacientů způsobují vážné problémy. Je znám jejich onkogenní potenciál u zvířat i u lidí. Transport MPyV v buňce stále není úplně objasněn. Virus vstupuje hladkými monopinocytickými váčky, pokračuje do časných a pozdních endozomů. Odtud je transportován do ER zatím neznámým mechanismem. Vyhýbá se Golgiho aparátu (GA). Možná cesta z pozdních endozomů je zprostředkovává GTPázou Rab9 do trans-Golgi síťoviny (TGN) a poté COPI váčky do ER. Výzkum, zdali MPyV využívá tuto dráhu na cestě do ER, v minulosti ukazoval různé výsledky. V této práci byl zkoumán účinek inhibitorů retrográdního transportu (Brefeldinu A, Golgicidu A) na infekci MPyV. Brefeldin A není zcela specifický, má vliv na celý endozomální systém. Golgicid A specificky rozrušuje transport přes TGN a GA. Oba inhibitory infekci MPyV inhibovaly. Konfokální mikroskopií bylo zjištěno, že část populace virionů kolokalizuje během jejich transportu k jádru s markery TGN a COPI váčků. MPyV nekolokalizoval s markerem cis-Golgi. Bohužel nebyl zjištěn vliv exprese dominantně negativní mutanty Rab9 na MPyV infekci, pro její vysokou cytotoxicitu. Avšak nadprodukce divokého typu Rab9 infekci usnadňovala. Výsledky podporují...
Mouse polyomavirus (MPyV) is a model virus of the Polyomaviridae family. Polyomaviruses are small non-enveloped DNA viruses. They cause severe problems to immunocompromised patients. Their oncogenic potential is known in animals and humans. Trafficking of MPyV within the cell is not clear yet. The virus enters via smooth monopinocytic vesicles and continues to early and late endosomes. From there, the virus is transported to the ER by unknown mechanism. It bypasses Golgi aparatus (GA). One possible pathway is from late endosomes to trans-Golgi network (TGN) facilitated by Rab9 GTPase and then in COPI vesicles to the ER. In this thesis, the effect of inhibitors of retrograde transport (Brefeldin A, Golgicide A) on MPyV infection was evaluated. Brefeldin A is not completely specific; it has effect on whole endosomal system. Golgicide A causes specific disruption of transport via TGN and GA. Both inhibitors suppressed infection of MPyV. Confocal microscopy revealed colocalization of some MPyV virions with markers of TGN and COPI vesicles. MPyV didn't colocalize with cis-Golgi marker. Unfortunately, the effect of overexpression of Rab9 dominant negative mutant couldn't been evaluated due to its high cytotoxicity. However, overexpression of wild type Rab9 slightly increased infectivity. The results...