Studium exprese placentárně specifických microRNA u pacientek se spontánním předčasným porodem a předčasným odtokem plodové vody (PPROM)
Study of placental specific microRNA expression in pacients with spontaneous preterm birth and preterm prelabor rupture of membranes
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/73835Identifiers
Study Information System: 142582
Collections
- Kvalifikační práce [20052]
Author
Advisor
Referee
Daňková, Pavlína
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Anthropology and Human Genetics
Department
Department of Anthropology and Human Genetics
Date of defense
15. 9. 2016
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Very good
Keywords (Czech)
microRNA, spontánní předčasný porod, předčasný odtok plodové vody, PTB, PPROMKeywords (English)
microRNA, spontaneous preterm birth, preterm prelabor rupture of membranes, PTB, PPROMMicroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující RNA o délce 18 až 25 nukleotidů hrající stěžejní roli v posttranskripční regulaci genové exprese. Existují miRNA, jejichž exprese je omezena pouze na určitý typ tkáně, a choroby, které jsou charakteristické unikátním expresním profilem miRNA. Předpokládala jsem, že by spontánní předčasný porod (PTB) a předčasný odtok plodové vody (PPROM) mohl být charakterizován unikátním expresním profilem miRNA. Sledovala jsem genovou expresi 15 placentárně specifických miRNA (miR-512-5p, miR-515- 5p, miR-516b-5p, miR-517-5p, miR-518b, miR-518f-5p, miR-519a-5p, miR-519d-3p, miR- 519e-5p, miR-520a-5p, miR-520h, miR-524-5p, miR-525-5p, miR-526a a miR-526b-5p) v placentární tkáni u pacientek s PTB, PPROM a u žen s fyziologickou graviditou a porodem v termínu (FG). PTB skupinu tvořilo 24 pacientek, PPROM skupinu 75 pacientek a FG skupinu 20 pacientek. Ke kvantifikaci genové exprese byla použita kvantitativní PCR v reálném čase. U PTB jsem v porovnání s kontrolami (FG) identifikovala 3 signifikantně upregulované miRNA (miR-516b-5p, miR-519d-3p a miR-524-5p) a 4 miRNA (miR-518b, miR-519a-5p, miR-520h a miR-526a) s trendem k upregulaci. U PPROM jsem identifikovala 3 miRNA (miR- 519d-3p, miR-520h a miR-526b-5p) s trendem k downregulaci v porovnání s kontrolami. Zároveň bylo...
MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs with a length of 18 to 25 nucleotides playing a pivotal role in post-transcriptional regulation of gene expression. There are miRNAs whose expression is limited to a certain tissue type and diseases which are characterized by a unique miRNA expression profile. I assumed spontaneous preterm birth (PTB) and preterm prelabor rupture of membranes (PPROM) would be characterized by a unique miRNA expression profile. I observed the gene expression of 15 placental specific miRNAs (miR-512-5p, miR-515-5p, miR-516b-5p, miR-517-5p, miR-518b, miR-518f-5p, miR-519a-5p, miR-519d-3p, miR-519e- 5p, miR-520a-5p, miR-520h, miR-524-5p, miR-525-5p, miR-526a and miR-526b-5p) in placental tissue of pacients with PTB, PPROM and women with term in labor pregnancies (FG). PTB group consisted of 24 pacients, PPROM group of 75 pacients and FG group of 20 pacients. Quantitative real-time PCR was used to quantify gene expression. In the group of PTB pregnancies I identified 3 significantly upregulated miRNAs (miR-516b-5p, miR-519d-3p and miR-524-5p) and 4 miRNAs (miR-518b, miR-519a-5p, miR-520h and miR-526a) with a trend to upregulation compared to controls (FG). In the group of PPROM pregnancies I identified 3 miRNAs (miR-519d-3p, miR-520h and miR-256b-5p) with a trend to...