Proteiny rodiny ALBA a jejich úloha ve vývoji samčího gametofytu

Abstract

Proteiny rodiny Alba jsou vysoce konzervovány napříč všemi říšemi organismů. U Archae a eukaryotních organismů se podílí na metabolismu RNA, zatímco u skupiny Crenarchae se pojí s dynamikou chromatinu. U eukaryot byly proteiny rodiny Alba studovány především u živočichů, kde jsou součástí podjednotky RNázy P/MRP. V předkládané práci se zabývám charakterizací proteinů rodiny Alba u modelové rostliny huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana). U huseníčku bylo podle homologie nalezeno šest genů kódujících tři proteiny podrodiny Rpp20 a tři z podrodiny Rpp25. Byla sledována lokalizace fúzních proteinů s GFP ve stabilních liniích ekotypu Columbia-0 obsahujících konstrukty připravené klonovací metodou Gateway® Technology. Proteiny ALBA byly lokalizovány pouze v diferenciační zóně kořene a samčím gametofytu. Na buněčné úrovni byly pozorovány v cytoplazmě a zatím neurčených částicích. Vzhledem k jejich množství a pravděpodobné funkční redundanci nebyly u jednoduchých mutant T-DNA inzerčních linií pozorovány významné fenotypové defekty v růstu a vývoji sporofytu ani gametofytu při srovnání s rostlinami Columbia-0. Výskyt a expresní profily proteinů rodiny Alba odpovídají možné funkci v diferenciaci a odpovědi na dehydrataci pozorované u rýže. U tabáku byly nalezeny skladované v EPP částicích v přítomnosti...

Alba family proteins are highly conserved in all domains of life. They are involved in RNA metabolism in Archae and Eucarya, while they are involved in the chromatin organisation in Crenarchaea. In animals, ALBA proteins were identified to associate with RNase P/MRP subunits. The objective of my thesis was the characterization of ALBA family proteins in a model plant Arabidopsis thaliana. The Arabidopsis genome contains six genes with close homology, three from Rpp20-like subfamily and three of Rpp25-like subfamily. Here I present the localization of GFP-fused proteins in Arabidopsis stable lines harbouring constructs cloned by Gateway® Technology. ALBA proteins were localized in the cytoplasm and undefined particles in root differentiation zone and in mature pollen. The characterization of the respective T-DNA insertion lines did not reveal significant phenotype defects in growth and development of sporophyte and gametophyte in comparison to Columbia-0 plants, probably because of likely functional redundancy od the paralogs. Expression profiles and localization of ALBA proteins suggest their possible role in differentiation and dehydration stress response in Oryza. They were also observed to associate with repressed mRNA transcripts in storage EPP particles. Collectively, I propose the likely role...