Zobrazit minimální záznam

Charakterizace mechanismů jaderného transportu proteinu 53BP1
dc.contributor.advisorMacůrek, Libor
dc.creatorLiďák, Tomáš
dc.date.accessioned2019-05-03T17:20:15Z
dc.date.available2019-05-03T17:20:15Z
dc.date.issued2016
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/73725
dc.description.abstractTumor suppressor p53-binding protein 1 (53BP1) is an integral part of a sophisticated network of cellular pathways termed as the DNA damage response (DDR). These pathways are specialized in the maintenance of genome integrity. Recently, it was reported that nuclear import of 53BP1 depends on importin ß. Here, I used fluorescence microscopy and co-immunoprecipitation experiments to identify its nuclear localization signal (NLS). Clusters of basic amino acids 1667-KRK-1669 and 1681-KRGRK- 1685 were required for 53BP1 interaction with importin ß and for its nuclear localization. Short peptide containing these two clusters was sufficient for interaction with importin ß and targeting EGFP to the nucleus. Additionally, the effect of 53BP1 phosphorylation at S1678 on its nuclear import was examined. Mimicking the phosphorylation in the 53BP1-S1678D mutant decreased the binding to importin ß and resulted in a mild defect in 53BP1 nuclear import. However, 53BP1 entered the nucleus continuously during the cell cycle, suggesting that CDK-dependent phosphorylation of S1678 probably does not significantly contribute to the regulation of 53BP1 nuclear transport. Taken together, 53BP1 NLS meets the attributes of a classical bipartite NLS. Although no cell cycle-dependent regulation of its import was observed, the...en_US
dc.description.abstractProtein 53BP1 se významně podílí na buněčné odpovědi na poškození DNA a udržování integrity genomu. Nedávno bylo popsáno, že je transportován do jádra prostřednictvím importinu ß. Cílem této práce bylo identifikovat jaderný lokalizační signál proteinu 53BP1, a to s využitím metod fluorescenční mikroskopie a imunoprecipitace. Získané výsledky ukázaly, že protein 53BP1 váže importin ß prostřednictvím svých dvou úseků bohatých na bazické aminokyseliny (1667-KRK-1669 a 1681-KRGRK- 1685). Tyto úseky byly rovněž nutné pro jeho vstup do jádra. Krátký polypeptid zahrnující tyto dva úseky vázal importin ß a umožnil transport GFP do jádra. Dále jsem se zaměřil na testování vlivu fosforylace serínu 1678 na transport proteinu 53BP1 do jádra. Mutanta 53BP1-S1678D, která mimikuje fosforylovaný serín na pozici 1678, měla výrazně sníženou schopnost vázat importin ß a byla hůře transportována do jádra. Nicméně žádné změny v transportu proteinu 53BP1 do jádra nebyly pozorovány, a tak se zdá, že fosforylace serínu 1678 cyklin-dependentními kinázami nebude významně regulovat jeho transport. Závěrem lze konstatovat, že protein 53BP1 má klasický bipartitní jaderný lokalizační signál. I když se transport proteinu 53BP1 do jádra nezdá být regulován v průběhu buněčného cyklu, může být regulován v odpovědi na jiné podněty....cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subject53BP1cs_CZ
dc.subjectjaderný lokalizační signálcs_CZ
dc.subjecttransport proteinů do jádracs_CZ
dc.subjectfosforylacecs_CZ
dc.subjectacetylacecs_CZ
dc.subject53BP1en_US
dc.subjectnuclear localization signalen_US
dc.subjectnuclear importen_US
dc.subjectphosphorylationen_US
dc.subjectacetylationen_US
dc.titleCharacterisation of the mechanisms regulating 53BP1 nuclear transporten_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2016
dcterms.dateAccepted2016-09-15
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId159476
dc.title.translatedCharakterizace mechanismů jaderného transportu proteinu 53BP1cs_CZ
dc.contributor.refereeBrábek, Jan
dc.identifier.aleph002104622
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBuněčná a vývojová biologiecs_CZ
thesis.degree.disciplineCellular and Developmental Biologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Cell Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBuněčná a vývojová biologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enCellular and Developmental Biologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csProtein 53BP1 se významně podílí na buněčné odpovědi na poškození DNA a udržování integrity genomu. Nedávno bylo popsáno, že je transportován do jádra prostřednictvím importinu ß. Cílem této práce bylo identifikovat jaderný lokalizační signál proteinu 53BP1, a to s využitím metod fluorescenční mikroskopie a imunoprecipitace. Získané výsledky ukázaly, že protein 53BP1 váže importin ß prostřednictvím svých dvou úseků bohatých na bazické aminokyseliny (1667-KRK-1669 a 1681-KRGRK- 1685). Tyto úseky byly rovněž nutné pro jeho vstup do jádra. Krátký polypeptid zahrnující tyto dva úseky vázal importin ß a umožnil transport GFP do jádra. Dále jsem se zaměřil na testování vlivu fosforylace serínu 1678 na transport proteinu 53BP1 do jádra. Mutanta 53BP1-S1678D, která mimikuje fosforylovaný serín na pozici 1678, měla výrazně sníženou schopnost vázat importin ß a byla hůře transportována do jádra. Nicméně žádné změny v transportu proteinu 53BP1 do jádra nebyly pozorovány, a tak se zdá, že fosforylace serínu 1678 cyklin-dependentními kinázami nebude významně regulovat jeho transport. Závěrem lze konstatovat, že protein 53BP1 má klasický bipartitní jaderný lokalizační signál. I když se transport proteinu 53BP1 do jádra nezdá být regulován v průběhu buněčného cyklu, může být regulován v odpovědi na jiné podněty....cs_CZ
uk.abstract.enTumor suppressor p53-binding protein 1 (53BP1) is an integral part of a sophisticated network of cellular pathways termed as the DNA damage response (DDR). These pathways are specialized in the maintenance of genome integrity. Recently, it was reported that nuclear import of 53BP1 depends on importin ß. Here, I used fluorescence microscopy and co-immunoprecipitation experiments to identify its nuclear localization signal (NLS). Clusters of basic amino acids 1667-KRK-1669 and 1681-KRGRK- 1685 were required for 53BP1 interaction with importin ß and for its nuclear localization. Short peptide containing these two clusters was sufficient for interaction with importin ß and targeting EGFP to the nucleus. Additionally, the effect of 53BP1 phosphorylation at S1678 on its nuclear import was examined. Mimicking the phosphorylation in the 53BP1-S1678D mutant decreased the binding to importin ß and resulted in a mild defect in 53BP1 nuclear import. However, 53BP1 entered the nucleus continuously during the cell cycle, suggesting that CDK-dependent phosphorylation of S1678 probably does not significantly contribute to the regulation of 53BP1 nuclear transport. Taken together, 53BP1 NLS meets the attributes of a classical bipartite NLS. Although no cell cycle-dependent regulation of its import was observed, the...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
thesis.grade.code1
dc.identifier.lisID990021046220106986


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV