Je sestřih pre-mRNA v kvasince S. cerevisiae procesem ko- nebo posttranskripčním?
Does the pre-mRNA splicing occur in S. cerevisiae co- or post-transcriptionally?
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/72728Identifikátory
SIS: 143072
Kolekce
- Kvalifikační práce [19055]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Kozáková, Eva
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Molekulární biologie a biochemie organismů
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
10. 9. 2014
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
kotranskripční sestřih, RNA polymeráza II, Saccharomyces cerevisiae, U snRNP, spliceosom, pre-mRNAKlíčová slova (anglicky)
cotranscriptional splicing, RNA polymerase II, Saccharomyces cerevisiae, U snRNP, spliceosome, pre-mRNADonedávna se pohlíželo na sestřih a transkripci jako na téměř nezávislé procesy. Dnes však řada studií přináší mnoho důkazů o jejich propojení, a to i u kvasinky Saccharomyces cerevisiae. Propojení těchto procesů je zprostředkováno zejména C-terminální doménou RNA polymerázy II, kterou tvoří tandemově se opakující heptapeptidové sekvence - YSPTSPS. Aminokyselinové zbytky heptapeptidové sekvence jsou v průběhu transkripce specificky fosforylovány, což reguluje samotný průběh transkripce a vazbu faktorů, mj. nezbytných pro úpravu vznikajícího transkriptu. Úpravy primárního transkriptu tak probíhají u vyšších eukaryot zejména kotranskripčně, tzn. před ukončením transkripce a uvolněním funkční mRNA. Názor na problematiku kotranskripčního sestřihu se u S. cerevisiae v posledních letech značně měnil. Nicméně dnes se pohlíží na sestřih pre-mRNA většiny genů S. cerevisiae jako na kotranskripční proces. RNA polymeráza II zpomaluje v oblasti terminálního exonu, což poskytuje jednotlivým komponentám spliceosomu dostatek času pro jejich sestavení na pre-mRNA a pro katalýzu sestřihu ještě před dokončením transkripce. Klíčová slova: kotranskripční sestřih, RNA polymeráza II, Saccharomyces cerevisiae, U snRNP, spliceosom, pre-mRNA
Until recently, the splicing and transcription were seen as almost independent processes. However, today a lot of studies provide plenty of evidence about their connection, even in the yeast Saccharomyces cerevisiae. The connection of these processes is particularly mediated by C-terminal domain of RNA polymerase II, which is consisted of tandemly repeated heptapeptide sequence - YSPTSPS. Amino acid residues of this heptapeptide sequence are specifically phosphorylated during transcription, which regulates transcription process and also the binding of specific factors. These factors are necessary for processing of the nascent transcript. Modifications of the primary transcript occur especially cotranscriptionally in higher eukaryotes, thus before the transcription is terminated and also before the functional mRNA is released. Opinion on cotranscriptional splicing in S. cerevisiae were significantly changed in the last years. However, nowadays the splicing of pre-mRNA of most genes in S. cerevisiae is seen as cotranscriptional process. RNA polymerase II pauses within the terminal exons and this pausing event provides sufficient time for each spliceosomal component to assemble on the pre-mRNA and also for catalysis of splicing before the transcription termination. Keywords: cotranscriptional...