Rekombinace mezi genem a pseudogenem pro glukocerebrosidasu jako mechanismus vzniku mutací u Gaucherovy choroby
Recombination between the gene and pseudogene for glucocerebrosidase as a mechanism of mutation generation in Gaucher disease
bachelor thesis (DEFENDED)
![Document thumbnail](/bitstream/handle/20.500.11956/71930/thumbnail.png?sequence=7&isAllowed=y)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/71930Identifiers
Study Information System: 159380
Collections
- Kvalifikační práce [20134]
Author
Advisor
Consultant
Vopálenský, Václav
Referee
Schierová, Michaela
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular Biology and Biochemistry of Organisms
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
4. 6. 2015
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
Gaucherova choroba, glukocerebrosidasa, pseudogen, genová konverze, rekombinace, rekombinantní alelyGaucherova choroba je autosomálně recesivní dědičné onemocněním způsobené deficitem lysosomálního enzymu β-glukocerebrosidasy. U pacientů s Gaucherovou chorobou byly nalezeny v genu pro β-glukocerebrosidasu komplexní mutace, které vznikly rekombinací s nefunkčním pseudogenem. Rekombinace mezi geny a jejich odpovídajícími pseudogeny hraje roli i při vzniku dalších lidských dědičných onemocnění. Mutantní alely vznikající při ženské i mužské meióze vedou k trvalému výskytu takovýchto patogenních alel v genofondu. Studium frekvence a rozsahu rekombinací v gametách, v genech asociovaných s lidskými onemocněními, má proto význam pro studium zátěže těmito nemocemi v populaci. Vyšetření rozsahu jednotlivých rekombinací v genu pro β-glukocerebrosidasu v lidských gametách je technicky obtížné. Využití nových technik jako sekvenování nové generace, sekvenování pomocí nanopórů nebo digitální PCR může poskytovat výhodu oproti dříve používaným technikám. Klíčová slova: rekombinace, genová konverze, pseudogen, β-glukocerebrosidasa, komplexní alely, Gaucherova choroba
Gaucher disease is an autosomal recessive disorder caused by the deficiency of β-glucocerebrosidase. Some Gaucher patients carry in their β-glucocerebrosidase genes complex mutations which apparently arose by a recombination with the non-functional β-glucocerebrosidase pseudogene. Recombination between genes and their corresponding pseudogenes plays a role in the development of other hereditary human diseases. Mutant alleles formed in male and female meiosis are a source of these variations in the gene pool. The study of frequency and scope of recombination events in human disease-associated genes in the gametes is of importance for evaluation of the disease burden in the population. The evaluation of the scope of single recombination events in the β-glucocerebrosidase gene in human gametes is technically challenging. Novel technologies such as next-generation sequencing, nanopore sequencing or droplet digital PCR may have advantages over previously used techniques in this application. Key words: recombination, gene conversion, pseudogene, β-glucocerebrosidase, complex alleles, Gaucher disease