Studium regulace regenerace jater za využití metod molekulární genetiky.

Abstract

Studium regulace regenerace jater za využití metod molekulární genetiky Regenerace jater je pozoruhodný děj vydatné obnovy tkáně nastupující po celé škále poškození. Regenerační schopnost jater je mezi útrobními orgány savců ojedinělá a hraje roli v patofyziologii různorodých jaterních onemocnění. Proces obnovy jater probíhá ve třech fázích, z nichž terminace byla dosud nejméně objasněna. Dokonce i otázky načasování terminace regenerace a úplnosti zotavení orgánu zůstávají i přes desítky let studia kontroverzní. Cílem předkládané disertační práce bylo analyzovat údaje o genové expresi ve vztahu k pozdní fázi jaterní regenerace. Hodnotili jsme průběh spontánního zotavování potkanů po 2/3 parciální hepatektomii. Vzhledem k chybění všeobecně uznávaného parametru úplnosti jaterní regenerace jsme navrhli vlastní ukazatel %LReg, založený na údajích o hmotnosti jater a celého těla zaznamenávaných v průběhu studie. Analýza genové exprese byla provedena nejprve metodou DNA čipů a následně pomocí RT-PCR v reálném čase. Stanovením exprese v celogenomovém měřítku jsme získali obsáhlou sadu dat pokrývající transkripční dynamiku čtrnácti pooperačních dnů po 2/3 parciální hepatektomii u dospělých potkaních samců. Tato intervence provedená u potkanů je zlatým standardem in vivo studií v oblasti regenerace jater a na našem...

Regulation of liver regeneration as assessed by means of molecular genetics Liver regeneration is a noteworthy phenomenon of a vigorous tissue recovery following a wide variety of damaging events. Regenerative ability of the liver is unique among the mammalian visceral organs and plays its role in pathophysiology of heterogeneous hepatic diseases. The recovery process occurs in three phases of which the termination remains the least elucidated. Even the questions of regeneration termination timing and of completeness of organ build-up are still controversial despite decades of studies. The aim of the present thesis was to analyse gene expression data pertinent to late phase of liver regeneration.We evaluated the course of spontaneous recovery in rats subjected to 2/3 partial hepatectomy. Because of lack of generally agreed parameter of hepatic regeneration completeness we proposed a proprietary indicator denoted as %LReg, based on organ and whole body weight assessments performed throughout the study. Gene expression analysis was first performed using DNA microarrays and consequently by real-time RT-PCR. Whole genome scale transcriptional analysis yielded vast amount of data covering gene expression dynamics of fourteen post-surgery days after 2/3 partial hepatectomy in adult male rats. This intervention in...