Vztah nádorového genotypu a fenotypu k diagnostice, prognóze a predikci kolorektálního karcinomu

Abstract

Colorectal cancer is one of the most common type of malignity. Despite of the existence of numerous studies focused on this carcinoma, there are still many unknown features regarding its diagnosis, treatment or prognosis. In the thesis we focused on the identification of novel prognostics markers that could be useful for the stratification of patients based on the disease outcomes. In the first study we immunohistochemically assessed expression of two proteins associated with cancer stem cells in the samples of primary colorectal cancer and matched liver metastasis. Goal of the study was to evaluate relation among expression of CD44 and CD133 and overall survival and disease free interval in our set of patients. We observed that increased ratio of CD133 positive compared to CD133 negative tumor glands resulted in longer disease free interval, finding which is opposite to the general view on the CD133 role in the cancer development. Our hypothesis is that we analyzed confined group of patients and followed a bit different goal, where we measured ratio between positive and negative glands in the view-field and not the intensity of staining as the previous studies did. Our second study was focused on the transcriptional analysis of the selected set of twelve genes using frozen samples from colorectal...

Kolorektální karcinom je jedním z nejvíce rozšířených typů maligních onemocnění. V jeho biologii a léčbě je stále velké množství otazníků a v této práci jsme se pokusili identifikovat nové prognostické znaky, které by mohly podat nové informace o vývoji tohoto nádoru a pomoci rozpoznat pacienty s těžším průběhem nemoci. V první části práce jsme se zaměřili na imunohistochemické značení dvou proteinů spojovaných s nádorovými kmenovými buňkami na vzorcích nádoru tlustého střeva a jeho jaterních metastáz. Cílem bylo vyhodnotit vztah mezi hladinou sledovaných proteinů CD44 a CD133 a celkovým a bezpříznakovým přežitím u studovaného souboru pacientů. Pozorovali jsme korelaci mezi zvýšeným množstvím CD133 pozitivních nádorových žlázek a prodloužením bezpříznakového přežití. Tento výsledek je v rozporu s obecným názorem ohledně vlivu CD133 na vývoj nádoru. Možným vysvětlením je použití vysoce specifikovaného souboru pacientů a odlišný metodický přístup, kdy jsme sledovali poměr CD133 pozitivních žlázek ke všem nádorovým žlázkám v zorném poli, nikoli absolutní intenzitu značení. Následně jsme se zaměřili na studium intenzity transkripce vybraného setu genů v zamražených vzorcích od pacientů s kolorektálním karcinomem. Hlavním cílem bylo detekovat rozdílnou hladinu odpovídajících mRNA mezi zdravou a...