Improvement of retroviral vectors for efficient gene transfer
Zdikonalování etrovirových vektorů pro účinný přenos genů
dissertation thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/6689Identifiers
Study Information System: 112676
Collections
- Kvalifikační práce [20096]
Author
Advisor
Referee
Šmahel, Michal
Ruml, Tomáš
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular and Cell Biology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
30. 9. 2008
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Pass
Souhrnvýsledků Retrovirovévektory, kteréjsou sďropnéefektivně přenášetgenetickou informaci do cilových buněk a integrovď se do jejich DNd jsou velice užitečrrépro mnoho experimentri ďe poúý stabitnípřenos geirůještěnemuslbý dostačující.V expresi přenesenýchgenůhrají významnou roli takéepigenetickémodifikace. Exprese mužebý přerrršenajiž v momantě integrace DNA vektoru nebo můžedochrázetkpostupnémuvypinaní kopii vektoru během ďouhodobých experimentů.Rebovirové vektory se mohou ve stabilitě exprcse výzrramně lišit ďe posfupnémutranskripčnímuumlčováni poďéhají všechny. Proto je zapotřebí mďifikovat retovirové vektory za účelemstabilizace jejich exprese v ciloých buňkóch. stabi|ní expreseje důIeátrizejmerravoblasti genovéterapie,kde je opakovrini bansdukce častonemožnénebove|mi komplikované. Retrovirovévektory odvozenéod ASLV jsou v savčíchbuňkách velmi účinně umlčovárry.Testova|ijsme moŽnoststabilizovatexpresi těchto vektorůinzerci vnitřního elementuCpG ostrovu (IE). cpc ostrovyjsou aliímésvou schopnostiudržovatpřilehlé promotorytranskripčněaktivní'Konstruova|ijsme vnitřní elementCpG' ostrovagenu pro adenosinfosforibosyltransferrázuo déIcel20bp' Tentoe|ementbyl vloŽenv sensei antisense orientacido tříruznýchm|stuvnitř LTR (nazačátekoblastiU3, mezi enhancerya pÍomotora na začátekoblasti U5)' Týo vektory...
44 CONCLUSIONS Retroviral vectors are transcriptionally unstable in mammalian cells. The ASLV- derived vectors are the most affected by silencing. We modified the vector by insertion of the CpG island inner element (IE) into the vector LTR in three different positions in either sense or antisense orientation. Each vector variant exhibited a certain extent of stabilization. The vector with insertion of a tandem of two IEs between the enhancer and the promoter was the most stable and exhibited almost no silencing after four months of cultivation in rodent and human cells. The IE comprises two high-affinity Sp1 binding sites. The presence of Sp1 binding sites is important for the protective effect of IE, but at least a part of the entire anti-silencing capacity is maintained in IE with mutated Sp1 sites. We identified the Tvc receptor of ASLV. The tvc gene encodes a 488-amino-acid protein most closely related to mammalian butyrophilins, members of the immunoglobulin protein family. To confirm the identification of the Tvc receptor, we disrupted both tvc alleles in normally susceptible DT40 cells. The DT40 tvc-/- clone was resistant to the ASLV(C) infection. We identified the mutation that results in decreased susceptibility to infection by ASLV subgroups B and D and resistance to ASLV subgroup E of line M...