Reciproké mikrodelece a mikroduplikace na lidských chromozómech

Abstract

Nealelická homologní rekombinace (NAHR) zprostředkovaná LCRs (low-copy repeats) produkuje v lidském genomu chromozomové přestavby, mezi něž patří mikrodelece a mikroduplikace. Tyto mutace způsobují velké množství syndromů, a proto jsou studovány stejně jako mechanismus jejich vzniku. Studie jsou umožněny rozvojem metod, s jejichž pomocí lze tyto kryptické aberace detekovat, jako je například komparativní genomová hybridizace (CGH). V současné době se často naráží na zrcadlový fenotyp k již popsaným mikrodelečním (mikroduplikačním) syndromům a genomovou analýzou se objeví přítomnost reciproké mikroduplikace (mikrodelece), která zasáhla gen citlivý na počet svých kopií nebo jiné důležité oblasti v lidském genomu. Příkladem takto postižených chromozomových oblastí (a asociovaných onemocnění) jsou regiony 1q21.1; 5q35.2-3 (Sotosův syndrom); 7q11.23 (Williams-Beurenův syndrom); 16p11.2 až 12.2 a 16p13.11; 17q11.2 (neurofibromatóza typu 1); 17p11.2-12 (CMT1A/HNPP) a 22q11.2 (DiGeorgeův syndrom a VCFS). Klíčová slova: mikroduplikace; mikrodelece; nealelické homologní rekombinace (NAHR); komparativní genomová hybridizace (CGH); zrcadlový fenotyp; reciproké přestavby.

Nonallelic homologous recombination (NAHR) mediated by LCRs (low-copy repeats) produces chromosomal rearrangements in the human genome. Those rearrangements include microdeletion and microduplication. Those mutations cause a great number of syndromes and thus are studied along with its genesis. Studies are enabled by the development of methods, which are able to detect those cryptic aberrations, e.g. comparative genomic hybridisation (CGH). Nowadays scientists often come across the mirror phenotype of the already described microdeletion (microduplication) syndromes. The presence of the reciprocal microduplication (microdeletion), which afflicted a gene sensitive to gene dosage or other important region of the human genome, is discovered by a genomic analysis. The examples of those affected chromosomal regions (and associated diseases) are areas 1q21.1; 5q35.2-3 (Sotos syndrome); 7q11.23 (Williams-Beuren syndrome); 16p11.2 až 12.2 a 16p13.11; 17q11.2 (Neurofibromatosis type 1); 17p11.2-12 (CMT1A/HNPP) a 22q11.2 (DiGeorge syndrome and VCFS). Key words: microduplication; microdeletion; nonallelic homologous recombination (NAHR); comparative genomic hybridisation (CGH); mirror phenotype; reciprocal rearrangements.