Ekologie hub, asociovaných s tlejícím dřevem v ekosystémech přirozených lesů
Ecology of deadwood-associated fungi in the ecosystems of nature-like forests
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/63028Identifiers
Study Information System: 121440
Collections
- Kvalifikační práce [20084]
Author
Advisor
Referee
Konopásek, Ivo
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Genetics, Molecular Biology and Virology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
9. 6. 2014
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
tlející dřevo, dekompozice, dřevorozkladné houby, sukcese, ITS - vnitřní přepisovaný mezerník, 454 pyrosekvenace, Ilumina MiSeq sekvenováníKeywords (English)
dead wood, decomposition, wood-decaying fungi, succession, ITS - internal transcribed spacer, next-generation-sequencingTlející dřevo hraje důležitou roli v lesním ekosystému z hlediska koloběhu uhlíku a živin, regenerace lesa a uchování biodiverzity. Poskytuje prostorové niky a potravní zdroje značnému množství hub, bakterií, bezobratlých a dalším organismům. Ligninocelulóza dřeva představuje velmi odolný a obtížně rozložitelný materiál, jehož dekompozice se účastní hlavně vláknité houby. Složení houbového společenstva se mění v průběhu dekompozice, ale vztah mezi kvalitativními vlastnostmi substrátu a společenstvem dekompozitorů není zdaleka objasněn. Tato práce je zaměřena na komplexní popis houbového společenstva tlejícího dřeva vzhledem k druhu stromu, stádiu rozkladu, objemu a fyzikálně-chemickým vlastnostem dřeva jako je pH, obsah uhlíku a dusíku. Pro charakterizaci houbového společenstva byly použity sekvenační metody nové generace - 454- pyrosekvenování a sekvenování na platformě Illumina MiSeq. Druh stromu, objem dřeva (větve, kmeny) a délka tlení byly hlavními proměnnými vysvětlujícími rozdíly ve složení společenstev. Počáteční kolonizace houbami byla rychlejší u větví nežli u kmenů - svědčily o tom vyšší hodnoty enzymových aktivit a vyšší obsah houbové biomasy. Se změnou společenstva hub v průběhu dekompozice se měnily i fyzikálně-chemické vlastnosti dřeva a hodnoty enzymových aktivit. Se stoupajícím...
Dead wood plays an important role in forest ecosystems in the context of C dynamics, nutrient cycling, forest regeneration and biodiversity. Decaying wood sustains biodiversity by providing habitats and energy for fungi, bacteria, invertebrates, and many other organisms. Dead wood is resistant to decomposition and its decay is driven mainly by filamentous fungi. Community structure of wood- inhabiting fungi changes during decomposition, but the relationship between substrate quality and decomposer community is still poorly understood. This work studied fungal community composition with respect to tree species, stage of decay, volume and physico-chemical properties (such as pH, carbon and nitrogen content) of dead wood. Fungi were identified using next generation sequencing approaches - 454-pyrosequencing and Illumina MiSeq sequencing. Tree species, volume of dead wood (branches x logs) and stage of decay were the main variables affecting fungal community composition. Higher enzyme activities and content of fungal biomass indicate faster colonization of small branches than tree trunks by fungi. Fungal community composition, wood chemical properties and enzyme activities changed during decomposition. Both content of nitrogen and fungal biomass increased during decomposition. Enzyme activites peaked...