Složení a aktivita mikrobiálního společenstva během rozkladu rostlinného opadu na dvou kontrastních lokalitách

Abstract

Rozklad organické hmoty v půdě je ovlivněn abiotickými a biotickými faktory, jejichž role se mění v závislosti na lokalitě, organickém substrátu a fázi rozkladu. Půdní mikrobiální společenstvo zasahuje do procesu rozkladu rostlinného opadu různým způsobem, a to se projevuje například změnami jejich abundance a produkcí enzymů rozkladných procesů. Tato práce poskytuje nové informace o odlišnosti průběhu rozkladu rostlinného opadu v půdní opadové vrstvě in situ, v závislosti na environmentálních podmínkách prostředí a složení rostlinného opadu. Práce se soustřeďuje na stanovení vztahu mezi dvěma hlavními skupinami půdních mikrobiálních rozkladačů hub a aktinobakterií, o jejichž vztahu v tomto kontextu zatím existuje jen málo informací. Vliv vybraných faktorů na rozkladné procesy byl sledován pomocí experimentu s opadovými sáčky. Ty byly naplněny rostlinným opadem odlišných vlastností. Astragalus exscapus z čeledi Fabaceae je charakteristický vyšším množstvím dusíku ve svých pletivech, Fagus sylvatica zase obsahuje velké množství uhlíku a ligninu a Carex humilis má o něco méně uhlíku než Fagus sylvatica a řadí se svým složením mezi Fagus sylvatica a Astragalus exscapus. Opadové sáčky (litterbags) se třemi druhy rostlinného substrátu, byly položeny pod opadovou vrstvu půdy na obou kontrastních...

Decomposition of organic matter in soil is influenced by abiotic and biotic factors and their role is different depending on site, organic substrate and its decomposition phase. Soil microbial community influences soil organic decomposition process in a different way, which is manifested, for example, by changes of microbial abundance and production of extracellular enzymes. The thesis aimed in determining relationship of two main soil microbial decomposers groups - fungi and actinobacteria in decomposition processes in situ. The impact of selected factors on decomposition processes were determined by experiment with litterbags, which were filled with litter of plant with different properties. Astragalus exscapus from the Fabaceae family contains high amounts of nitrogen in the tissues, Fagus sylvatica contains high amounts of carbon and lignin and Carex humilis has less carbon in the tissues than Fagus sylvatica falling in tissue element composition between Astragalus exscapus and Fagus sylvatica. Litterbags with three plant species were put under a litter layer at both contrasting sites. Litterbags and samples of soil were collected every two months during the years 2011-2012. Each litterbag was weighted, DNA was isolated from litter and soil samples and analyses of quantitative real time PCR...