Morphological and molecular diversity of the free-living representatives of the family Metopidae and the discovery of a new lineage of anaerobic ciliates
Morfologická a molekulární diverzita volně žijících zástupců čeledi Metopidae a objev nové linie anaerobních nálevníků
diplomová práce (OBHÁJENO)
![Náhled dokumentu](/bitstream/handle/20.500.11956/62022/thumbnail.png?sequence=7&isAllowed=y)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/62022Identifikátory
SIS: 143660
Kolekce
- Kvalifikační práce [19600]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Fiala, Ivan
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Protistologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra zoologie
Datum obhajoby
8. 6. 2015
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Výborně
Anoxické sedimenty slouží jako životní prostředí mnohým nálevníkům. Přestože je známo, že anaerobióza vznikla nezávisle v několika liniích z 11 hlavních linií Ciliophora, a anaerobové byli nalezeni v nejméně osmi liniích nálevníků, diverzita anaerobních nálevníků třídy Armophorea je podstatně přehlížena. Podobně, jen velmi málo je známo o jejich hydrogenosomech. Abychom prohloubili vědomosti o diverzitě volně žijících zástupců třídy Armophorea, kultivovali jsme více než 100 armophoridních kmenů ze sladkovodních, brakických, i mořských anoxických sedimentů z celého světa. Stanovili jsme jejich SSU rDNA sekvence, provedli barvení protargolovou technikou, a studovali jejich morfologii ve světelné mikroskopii. Kromě toho jsme použili transmisní elektronovou mikroskopii pro posouzení ultrastruktury některých kmenů. Identifikovali jsme několik nových linií, které pravděpodobně představují nové druhy. Významnou součástí práce je objevení nové hluboké linie mořských anaerobních nálevníků - Muránů. Podle analýzy SSU rDNA se větví mezi třídami skupiny SAL (Spirotrichea, Armophorea a Litostomatea), ale tvoří samostatnou hlubokou linii, případně novou třídu. Došli jsme k závěru, že anoxické sedimenty ukrývají velkou diverzitu dosud nepopsaných anaerobních nálevníků. Klíčová slova: Anerobióza, Armophorea,...
Anoxic sediments host a wide variety of ciliates. Although it is known that anaerobiosis has independently arisen in several lineages of the main 11 lineages of Ciliophora and anaerobes have been found in at least eight lineages of ciliates, the diversity of anaerobic ciliates of the class Armophorea is severely understudied. Similarly, not much is known about their hydrogenosomes. To deepen our knowledge about the diversity of Armophorea, we have cultivated more than 100 armophorid strains from fresh water, brackish, and marine anoxic sediments worldwide. We determined their SSU rDNA sequences, performed protargol staining techniques, and studied light-microscopic morphology. In addition, we used transmission electron microscopy to assess the ultrastructure of some of the strains. Several novel clades of metopids, the free-living anaerobic ciliates of the class Armophorea, were identified. Importantly, a new deep lineage of marine anaerobic ciliates, muranes, was discovered. According to the SSU rDNA analysis, it is related to SAL group (Spirotrichea, Armophorea, and Litostomatea) with Cariacotrichea, but forms a separate lineage, possibly a novel class. We conclude that anoxic sediments harbour a high diversity of undescribed anaerobic ciliates. Key words: Anaerobiosis, Armophorea, ciliates,...