Show simple item record

Purification and characterization of selected enzymes from Rhizobium radiobacter R89 catalysing oxidation/reduction reactions of C-hydroxylated morphine skelets.
dc.contributor.advisorŠulc, Miroslav
dc.creatorZahradník, Jiří
dc.date.accessioned2017-05-16T04:05:14Z
dc.date.available2017-05-16T04:05:14Z
dc.date.issued2013
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/54853
dc.description.abstractBakterie z rodiny Rhizobiaceae jsou známé přítomností mnoha enzymů účastnících se metabolismu dusíku. A to nejen z pohledu fixace dusíku (tzv.diazatrofie) a schopnosti tvořit s rostlinami mutualistické vztahy, ale i z pohledu rostlinné patogeneze (genus Agrobacterium). Rhizobium radiobacter R89 (uložen v České sbírce mikroorganismů v Brně jako R89-1) je bakteriální kmen schopný biotransformace kodeinu a morfinu na celé spektrum farmakologicky významných derivátů. Cílem této práce je purifikace a charakterizace dvou vybraných enzymů katalyzujících oxidačně-redukční reakce, které jsou klíčové pro začátek biodegradační dráhy morfinových skeletů. Nejprve byl charakterizován biotransformační potenciál daného kmene a pro purifikaci enzymů zodpovědných za zvolené reakce byly použity biochemické, molekulárně biologické a bioinformační metody. Vzhledem k neúspěšné purifikaci enzymů z původního materiálu byly strukturní geny kódující proteiny klonovány a heterologně exprimovány v bakteriálním expresním systému a následně charakterizovány. Nalezená proteinová sekvence a enzymová charakterizace (základní kinetické parametry, substrátová specifita a teplotní stabilita) odhalily odlišný původ enzymů a tak i objasnily neúspěch původního purifikačního postupu z mikroorganismu Rhizobium radiobacter R89.cs_CZ
dc.description.abstractThe Rhizobiaceae bacteria are known for its varied nitrogen metabolism: especially its nitrogen fixation, so called diazotrofia, its capability of symbiosis with plants, or on the contrary plant pathogenesis (genus Agrobacterium). Rhizobium radiobacter R89 (stored in Czech Collection of Microorganism, in Brno as R89-1) is bacteria strain capable of codeine and morphine biotransformation to whole spectrum of pharmacologically significant derivates. This work is focused on purification and characterization of two selected enzymes that catalyze oxidation-reduction reactions, the crucial beginning of morphine skelets biodegradation. At the first, the biotransformational potential of the strain was evaluated and biochemical, molecular biological and bioinformatical approaches were employed to purify the responsible enzymes. Considering unsuccessful purification from Rhizobium radiobacter R89-1, the proteins structural genes were cloned and heterologously expressed in bacterial system and afterward characterized. Found protein sequence and enzyme characterization (basic kinetic measurements, substrate specificity and thermo- stability) have revealed different origin of the enzymes and clarify reasons why the original purification procedure was not successful.en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectalkoholdehydrogenasacs_CZ
dc.subjectRhizobiumcs_CZ
dc.subjectpurifikace a charakterizacecs_CZ
dc.subjectalcohol-dehydrogenaseen_US
dc.subjectRhizobiumen_US
dc.subjectpurification and characterisationen_US
dc.titlePurifikace a charakterizace vybraných enzymů z Rhizobium radiobacter R89 katalyzujících oxidačně-redukční reakce na uhlíku C-hydroxylovaných morfinových skeletů.cs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2013
dcterms.dateAccepted2013-05-28
dc.description.departmentDepartment of Biochemistryen_US
dc.description.departmentKatedra biochemiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId116120
dc.title.translatedPurification and characterization of selected enzymes from Rhizobium radiobacter R89 catalysing oxidation/reduction reactions of C-hydroxylated morphine skelets.en_US
dc.contributor.refereeČerná, Věra
dc.identifier.aleph001604049
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemistryen_US
thesis.degree.disciplineBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiochemistryen_US
uk.degree-program.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-program.enBiochemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csBakterie z rodiny Rhizobiaceae jsou známé přítomností mnoha enzymů účastnících se metabolismu dusíku. A to nejen z pohledu fixace dusíku (tzv.diazatrofie) a schopnosti tvořit s rostlinami mutualistické vztahy, ale i z pohledu rostlinné patogeneze (genus Agrobacterium). Rhizobium radiobacter R89 (uložen v České sbírce mikroorganismů v Brně jako R89-1) je bakteriální kmen schopný biotransformace kodeinu a morfinu na celé spektrum farmakologicky významných derivátů. Cílem této práce je purifikace a charakterizace dvou vybraných enzymů katalyzujících oxidačně-redukční reakce, které jsou klíčové pro začátek biodegradační dráhy morfinových skeletů. Nejprve byl charakterizován biotransformační potenciál daného kmene a pro purifikaci enzymů zodpovědných za zvolené reakce byly použity biochemické, molekulárně biologické a bioinformační metody. Vzhledem k neúspěšné purifikaci enzymů z původního materiálu byly strukturní geny kódující proteiny klonovány a heterologně exprimovány v bakteriálním expresním systému a následně charakterizovány. Nalezená proteinová sekvence a enzymová charakterizace (základní kinetické parametry, substrátová specifita a teplotní stabilita) odhalily odlišný původ enzymů a tak i objasnily neúspěch původního purifikačního postupu z mikroorganismu Rhizobium radiobacter R89.cs_CZ
uk.abstract.enThe Rhizobiaceae bacteria are known for its varied nitrogen metabolism: especially its nitrogen fixation, so called diazotrofia, its capability of symbiosis with plants, or on the contrary plant pathogenesis (genus Agrobacterium). Rhizobium radiobacter R89 (stored in Czech Collection of Microorganism, in Brno as R89-1) is bacteria strain capable of codeine and morphine biotransformation to whole spectrum of pharmacologically significant derivates. This work is focused on purification and characterization of two selected enzymes that catalyze oxidation-reduction reactions, the crucial beginning of morphine skelets biodegradation. At the first, the biotransformational potential of the strain was evaluated and biochemical, molecular biological and bioinformatical approaches were employed to purify the responsible enzymes. Considering unsuccessful purification from Rhizobium radiobacter R89-1, the proteins structural genes were cloned and heterologously expressed in bacterial system and afterward characterized. Found protein sequence and enzyme characterization (basic kinetic measurements, substrate specificity and thermo- stability) have revealed different origin of the enzymes and clarify reasons why the original purification procedure was not successful.en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemiecs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV