Konformační změny cytochromu c v kyselém prostředí

Abstract

Část mojí práce bola zaměřená na rešerši literatury o konformačních změnách cytochromu c. Hlavní cíl výzkumu o této bílkovině je objasnit důležitost a roli konformačních změn. Cytochrom c se váže na vnitřní mitochondriální membránu bojatou na kardiolipin. Předpokládá se, že konformační stavy podobné molten globule hrají zatím neobjasněnou roli při spuštění apoptosy. Cytochrom c je modelový protein pro studium sbalování bílkovin. Je to jednoduchý, malý protein, který lze lehce získat a je možné ho studovat pomocí široké škály experimentálních technik. Druhá část projektu přináší experimenty s koňským cytochromem c v kyselém prostředí s přídavkem anorganických solí. Konformační změny jsem měřil pomocí UV-VIS spektrofotometrie v čtyřech oblastech absorpčního spektra - oblast absorpce aromatických aminokyselin, Soretův pás, Q pás a CT pás. Použil jsem techniku derivačních spekter pro získaní dalších informací.

One part of my work was focused on literature review within the conformational changes of cytochrome c under various circumstances. Main goal of these studies is to clarify the importance of conformational changes of cytochrome c as the cell death messenger. Cytochrome c binds to cardiolipin- rich inner mitochondrial membrane and a molten globule-like intermediate is supposed to play still unknown role in cell death start. Cytochrom c is also common model protein in a "simple" protein folding problem. It is simple, small molecule and easy to obtain protein that can be studied by a broad variety of techniques. The second part of my work presents conformational study of horse heart ferricytochrome c under acidic conditions with addition of inorganic salts. These conformational changes were monitored using UV/VIS spectrophotometry in four areas of absorption spectrum - aromatic amino acids absorption area and so called Soret band, Q-band and CT band. Derivative of these spectra were used in order to obtain higher-resolution informations.