Úloha Hac1p pri morfogenéze kvasinkových kolónií
The effect of HAc1p on the development of yeast colony
Úloha Hac1p při morfogenezi kvasinkových kolonií
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/54359Identifiers
Study Information System: 117924
Collections
- Kvalifikační práce [20312]
Author
Advisor
Referee
Pichová, Iva
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Genetics, Molecular Biology and Virology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
17. 9. 2013
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Slovak
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
kvasinky, strukturované kolonie, Hac1p, stres v ER, Flo11p, Sec61pKeywords (English)
yeast, structured colony, Hac1p, unfolded protein response, Flo11p, Sec61pPrírodné kmene kvasiniek Saccharomyces cerevisiae vytvárajú na pevnom médiu štruktúrované kolónie podobné biofilmom, čo im umožňuje dlhodobé prežívanie v nepriaznivých podmienkach prostredia. Molekulárny mechanizmus časopriestorového vývoja kolónií a rezistencie voči nehostinným podmienkam je však stále z veľkej časti neznámy. Hlavným cieľom tejto práce bola analýza vplyvu génu HAC1 na morfológiu kolónií. Proteín Hac1p aktivuje bunkovú odpoveď na prítomnosť nezbalených proteínov (UPR), v rámci ktorej sa aktivuje expresia génov kódujúcich proteíny zahrnuté v sekrečnej dráhe a potláčaní stresu v endoplazmatickom retikule (ER). Vplyv delécie génu HAC1 sa preukázal i za nestresových podmienok a viedol ku radikálnemu zníženiu vrásčitosti kolónií delečných kmeňov odvodených od dvoch prírodných kmeňov S. cerevisiae (PORT a BR-F- Flo11p-GFP) a laboratórneho kmeňa ΣSh , ktoré tvoria polovrásčité alebo vrásčité kolónie. Mutantné kmene hac1∆ mali zároveň spomalený vegetatívny rast, znížený charakter vrastania do agaru a zníženú tvorbu zhlukov buniek. U kmeňov hac1∆ odvodených od kmeňa BR-F- Flo11p-GFP bola zistená veľmi nízka hladina povrchového adhezínu Flo11p nevyhnutného pre vytvorenie štruktúrovanej architektúry kvasinkovej kolónie. Je pravdepodobné, že produkcia niektorého proteínu, zúčastňujúceho sa...
On solid surfaces wild strains of Saccharomyces cerevisiae form biofilm-like, structured colonies enabling them to survive long-term in hostile environments in the wild. However, the molecular mechanisms underlying the spatio-temporal development of colonies and their resistance to hostile conditions are still largely unknown. In this study, we analyzed the effect of the HAC1 gene on the colony morphology of wild strains of S. cerevisiae. The transcription factor Hac1p activates the unfolded protein response (UPR), which leads to activation of the expression of genes encoding components of the protein secretory pathway, and genes involved in stress responses in the endoplasmic reticulum (ER). The impact of HAC1 deletion is significant even under non-stress conditions and causes a radical reduction of structured colony architecture in hac1∆ strains derived from two wild S. cerevisiae strains (PORT and BR-F-Flo11p-GFP) and one laboratory ΣSh strain forming semi-fluffy or fluffy colonies. The hac1∆ strains exhibit a decreased vegetative growth rate, reduced cell attachment to the agar and an ineffective cell-cell adhesion resulting in decreased flocculation. The hac1∆ strains derived from BR-F-Flo11p-GFP contain a low level of Flo11p surface adhesin which is considered very important for the proper...