Show simple item record

Molekulární detekce invazivních mykotických onemocnění u imunokompromitovaných pacientů
dc.contributor.advisorŽivný, Pavel
dc.creatorBašková, Lenka
dc.date.accessioned2020-11-26T18:46:21Z
dc.date.available2020-11-26T18:46:21Z
dc.date.issued2013
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/53264
dc.description.abstract5 3. Summary Molecular detection of invasive fungal disease in immunocompromised patients In my work I have been able to establish three different PCR-based assays for the quantitative detection and identification of fungal DNA. Two DNA-based detection assays termed PanAC PCR and panfungal PCR based on the real-time quantitative (RQ-PCR) technology were designed to detect and quantify the most important fungal genera currently associated with IFD including a large number of pathogenic moulds and yeasts. Upon standardization of both RQ-PCR techniques, the applicability in the clinical setting was assessed by investigating a series of clinical specimens from patients with documented fungal infection, and by prospectively studying patient cohorts at high risk of IFD. In view of the importance of precise identification of the causative fungal pathogen, a semi-nested PCR method coupled with fluorescent capillary electrophoresis detection was established. It facilitates rapid identification of fungal species in clinical materials that test positive for IFD using one of the broad-range screening assays. This method was also tested in a population of patients with documented fungal infections to assess its clinical potential.en_US
dc.description.abstract4 2. Souhrn Molekulární detekce invazivních mykotických onemocnění u imunokompromitovaných pacientů V dizertační práci se mi podařilo vyvinout tři PCR metody pro kvantitativní detekci a identifikaci kvasinkové a plísňové DNA. Dvě metody založené na kvantifikaci v reálném čase s názvem PanAC PCR a "panfungal" PCR byly navrhnuty tak, aby detekovaly a kvantifikovaly široké spektrum plísní a kvasinek způsobujících invazivní mykotická onemocnění. Význam metod pro klinické využití byl v rámci standardizace testován retrospektivně na souborech pacientů s již dokumentovanými invazivními mykózami a dále pak prospektivně na souborech pacientů s vysokým rizikem invazivní mykózy. Vzhledem k významu přesné identifikace původce onemocnění byla vyvinuta "semi-nested" PCR s fluorescenční detekcí pomocí kapilární elektroforézy umožňující rychlou identifikaci plísně či kvasinky v klinickém materiálu, který byl pozitivní v jedné ze širokospektrých screeningových PCR. Možnost klinického využití této metody byla taktéž testována na populaci pacientů s dokumentovanou invazivní mykózou.cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Lékařská fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.titleMolecular detection of invasive fungal disease in immunocompromised patientsen_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2013
dcterms.dateAccepted2013-06-18
dc.description.departmentDepartment of Medical Biochemistryen_US
dc.description.departmentÚstav lékařské biochemiecs_CZ
dc.description.facultyLékařská fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Medicine in Hradec Královéen_US
dc.identifier.repId107295
dc.title.translatedMolekulární detekce invazivních mykotických onemocnění u imunokompromitovaných pacientůcs_CZ
dc.contributor.refereeBílková, Zuzana
dc.contributor.refereeTrka, Jan
dc.identifier.aleph001651138
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programLékařská chemie a biochemiecs_CZ
thesis.degree.programMedical Chemistry and Biochemistryen_US
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csLékařská fakulta v Hradci Králové::Ústav lékařské biochemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Medicine in Hradec Králové::Department of Medical Biochemistryen_US
uk.faculty-name.csLékařská fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Medicine in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csLFHKcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csLékařská chemie a biochemiecs_CZ
uk.degree-program.enMedical Chemistry and Biochemistryen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.cs4 2. Souhrn Molekulární detekce invazivních mykotických onemocnění u imunokompromitovaných pacientů V dizertační práci se mi podařilo vyvinout tři PCR metody pro kvantitativní detekci a identifikaci kvasinkové a plísňové DNA. Dvě metody založené na kvantifikaci v reálném čase s názvem PanAC PCR a "panfungal" PCR byly navrhnuty tak, aby detekovaly a kvantifikovaly široké spektrum plísní a kvasinek způsobujících invazivní mykotická onemocnění. Význam metod pro klinické využití byl v rámci standardizace testován retrospektivně na souborech pacientů s již dokumentovanými invazivními mykózami a dále pak prospektivně na souborech pacientů s vysokým rizikem invazivní mykózy. Vzhledem k významu přesné identifikace původce onemocnění byla vyvinuta "semi-nested" PCR s fluorescenční detekcí pomocí kapilární elektroforézy umožňující rychlou identifikaci plísně či kvasinky v klinickém materiálu, který byl pozitivní v jedné ze širokospektrých screeningových PCR. Možnost klinického využití této metody byla taktéž testována na populaci pacientů s dokumentovanou invazivní mykózou.cs_CZ
uk.abstract.en5 3. Summary Molecular detection of invasive fungal disease in immunocompromised patients In my work I have been able to establish three different PCR-based assays for the quantitative detection and identification of fungal DNA. Two DNA-based detection assays termed PanAC PCR and panfungal PCR based on the real-time quantitative (RQ-PCR) technology were designed to detect and quantify the most important fungal genera currently associated with IFD including a large number of pathogenic moulds and yeasts. Upon standardization of both RQ-PCR techniques, the applicability in the clinical setting was assessed by investigating a series of clinical specimens from patients with documented fungal infection, and by prospectively studying patient cohorts at high risk of IFD. In view of the importance of precise identification of the causative fungal pathogen, a semi-nested PCR method coupled with fluorescent capillary electrophoresis detection was established. It facilitates rapid identification of fungal species in clinical materials that test positive for IFD using one of the broad-range screening assays. This method was also tested in a population of patients with documented fungal infections to assess its clinical potential.en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Lékařská fakulta v Hradci Králové, Ústav lékařské biochemiecs_CZ
thesis.grade.codeP
uk.publication-placeHradec Královécs_CZ
dc.identifier.lisID990016511380106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV