Vztah mezi genetickými polymorfismy DNA reparačních genů a jejich expresí u zdravé populace (s výhledem na stanovení u onkologických pacientů).

Abstract

DNA damage response is a complex system responsible for protection of a cell against internal and external DNA damaging agents and in maintaining genome integrity. Many of genes participating in DNA damage response pathways are polymorphic. Genetic polymorphisms in coding and regulatory regions may have impact on the function of proteins encoded by the genes. Phenotypic effect of single nucleotide polymorphisms (SNPs) is subject of investigation in connection with the ability of a cell to manage genotoxic stress and subsequently, in relation to cancer susceptibility. The aim of this thesis was to evaluate the association between SNPs in DNA repair genes (hOGG1, XRCC1, XPC) and cell cycle genes (TP53, p21CDKN1A , BCL2 and BAX) and their mRNA expression in peripheral blood lymphocytes from individuals occupationally exposed to styrene and control individuals. The aim was extended to analyses of relationships between mRNA expression levels of the above-mentioned genes and markers of exposure to styrene (concentration of styrene in blood and in air), markers of DNA damage (single strand breaks - SSBs, and endonuclease III specific sites - Endo III sites) and the base excision repair (BER) capacity, by means of γ-irradiation specific DNA repair rates and oxidative repair. Study on the group of healthy...

Odpověď na poškození DNA je komplexní systém, odpovědný za ochranu buňky proti vnitřním a vnějším vlivům poškozujícím DNA a za udržování integrity genomu. Mnoho genů, které se účastní signálních drah reagujících na poškození DNA, je polymorfních. Genetické polymorfismy v kódujících a regulačních oblastech mohou mít vliv na funkci proteinů, které tyto geny kódují. Fenotypový efekt jednonukleotidových polymorfismů (SNPs), je předmětem zkoumání v souvislosti se schopností buňky zvládat genotoxický stres a následně ve vztahu k riziku vzniku onkologického onemocnění. Cílem této práce bylo zhodnotit vztah mezi SNPs v genech zodpovědných za opravy poškození DNA (hOGG1, XRCC1, XPC) a genech buněčného cyklu (TP53, p21CDKN1A , BCL2 a BAX) a expresí na úrovni mRNA v lymfocytech periferní krve u subjektů exponovaných styrenu v pracovním prostředí a u kontrolních subjektů. Cíl byl rozšířen na analýzu vztahu mezi expresí uvedených genů na úrovni mRNA a markery expozice styrenu (koncentrace styrenu v krvi a ve vzduchu), markery poškození DNA (jednořetězcové zlomy - SSBs; místa specifická pro endonukleázu III - Endo III místa) a kapacitou bázové excizní opravy (BER) měřené pomocí míry opravy poškození DNA způsobeného γ-zářením a schopností opravovat oxidativní poškození. Studie na skupině zdravých jedinců...